28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0710 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0710  transcription factor TFIIE, alpha subunit  100 
 
 		 178 aa  370  1e-102  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1244  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  34.59 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2279  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  37.25 
 
 		 176 aa  102  4e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.933385 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1150  transcription initiation factor E subunit alpha  32.48 
 
 		 183 aa  95.9  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1033  transcription initiation factor E subunit alpha  30.94 
 
 		 185 aa  89  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0325255 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1033  transcription initiation factor E subunit alpha  33.09 
 
 		 185 aa  89.4  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0913  transcription initiation factor E subunit alpha  30.22 
 
 		 185 aa  88.6  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1644  transcription initiation factor E subunit alpha  30.22 
 
 		 185 aa  88.6  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.275573  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1524  transcription factor TFIIE, alpha subunit  31.51 
 
 		 173 aa  85.9  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1279  transcription factor TFIIE, alpha subunit  29.73 
 
 		 173 aa  84.7  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.11333 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0196  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  34.09 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2797  transcription factor TFIIE, alpha subunit  29.68 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0975699 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2330  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  36.69 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.373955 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1650  transcription factor TFIIE, alpha subunit  32.21 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0035  transcription factor TFIIE, alpha subunit  31.29 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1074  transcription factor TFIIE, alpha subunit  32.65 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0458  hypothetical protein  28.91 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0032  transcription factor TFIIE, alpha subunit  31.97 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00767088 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2009  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  32.8 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.735877  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1708  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  34.09 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1607  transcription factor TFIIE subunit alpha  29.87 
 
 		 171 aa  67  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3157  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  33.33 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.484396  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0285  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  33.08 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.137025  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0965  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  32.46 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2147  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  31.58 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0372  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  31.3 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000142035  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1388  transcription factor TFIIE, alpha subunit  29.55 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0274  regulatory protein MarR  34.85 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000573211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>