More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3596 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3596  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  100 
 
 		 519 aa  1003    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4697  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  51.18 
 
 		 527 aa  434  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.269439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4399  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  49.9 
 
 		 525 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4177  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  49.9 
 
 		 525 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0530735  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4243  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  49.9 
 
 		 525 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0209492  normal  0.158943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8198  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  44.44 
 
 		 538 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2036  ATP-binding region ATPase domain protein  47.99 
 
 		 536 aa  359  6e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3869  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  45.79 
 
 		 540 aa  355  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0780654  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2258  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  47.86 
 
 		 542 aa  353  4e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0498367  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4414  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  45.64 
 
 		 558 aa  347  4e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25730  PAS domain S-box  46.35 
 
 		 520 aa  342  1e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1529  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  39.41 
 
 		 543 aa  320  3e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1529  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  41.57 
 
 		 569 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000208522 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0516  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  50.34 
 
 		 551 aa  286  5e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.494756  normal  0.0577704 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1162  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  40.77 
 
 		 528 aa  270  5.9999999999999995e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.308176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5600  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  37.26 
 
 		 549 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0065  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  38.95 
 
 		 529 aa  234  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8065  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  37.89 
 
 		 583 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3705  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  38.48 
 
 		 527 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2555  sensory histidine kinase DcuS  29.58 
 
 		 538 aa  213  9e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129089 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3867  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.22 
 
 		 543 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3902  sensory histidine kinase DcuS  29.22 
 
 		 543 aa  211  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4592  sensory histidine kinase DcuS  29.22 
 
 		 543 aa  211  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5639  sensory histidine kinase DcuS  29.22 
 
 		 543 aa  211  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4679  sensory histidine kinase DcuS  29.03 
 
 		 543 aa  210  6e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4366  sensory histidine kinase DcuS  29.03 
 
 		 543 aa  207  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.206477  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37840  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.27 
 
 		 527 aa  207  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.183307 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2789  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.29 
 
 		 536 aa  206  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4559  sensory histidine kinase DcuS  29.64 
 
 		 543 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4650  sensory histidine kinase DcuS  29.64 
 
 		 543 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.414572  normal  0.461897 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4650  sensory histidine kinase DcuS  29.64 
 
 		 543 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4567  sensory histidine kinase DcuS  29.45 
 
 		 543 aa  203  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0700  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.8 
 
 		 543 aa  202  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1959  sensory histidine kinase DcuS  30.77 
 
 		 533 aa  202  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516955 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4699  sensory histidine kinase DcuS  29.45 
 
 		 543 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3624  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  39.33 
 
 		 534 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1396  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.78 
 
 		 556 aa  198  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0792453  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5077  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.47 
 
 		 558 aa  196  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.669392 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0597  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.95 
 
 		 524 aa  195  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0038  sensory histidine kinase DcuS  30.13 
 
 		 542 aa  194  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4725  sensory histidine kinase DcuS  27.29 
 
 		 534 aa  193  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0044  sensory histidine kinase DcuS  29.94 
 
 		 542 aa  192  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0489  sensory histidine kinase DcuS  27.33 
 
 		 534 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0490  sensory histidine kinase DcuS  27.1 
 
 		 534 aa  189  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0545  sensory histidine kinase DcuS  26.55 
 
 		 534 aa  189  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.847766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0632  sensory histidine kinase DcuS  27.33 
 
 		 534 aa  189  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0576  sensory histidine kinase DcuS  26.55 
 
 		 534 aa  189  8e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0614  sensory histidine kinase DcuS  27.15 
 
 		 534 aa  189  9e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0639  sensory histidine kinase DcuS  27.15 
 
 		 534 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0487  sensory histidine kinase DcuS  27.13 
 
 		 534 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0496  sensory histidine kinase DcuS  27.95 
 
 		 528 aa  186  8e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0965  sensor histidine kinase  26.92 
 
 		 529 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3991  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.36 
 
 		 553 aa  185  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00164194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4102  sensory histidine kinase DcuS  27.55 
 
 		 537 aa  183  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02431  sensor kinase CitA  29.49 
 
 		 541 aa  183  8.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1009  sensor histidine kinase  26.73 
 
 		 529 aa  182  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4346  sensor histidine kinase  26.59 
 
 		 529 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149156  hitchhiker  0.000000000000186115 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1004  sensor histidine kinase  26.32 
 
 		 529 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.68776e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0811  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.66 
 
 		 529 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0527  sensor histidine kinase  25.76 
 
 		 536 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0559  sensor histidine kinase  25.76 
 
 		 536 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1210  putative sensor kinase citA  31.69 
 
 		 538 aa  177  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000551679  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0869  sensor histidine kinase  26.92 
 
 		 529 aa  177  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0923  sensor histidine kinase  26.92 
 
 		 529 aa  177  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0515  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.98 
 
 		 526 aa  177  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1089  sensor histidine kinase  26.54 
 
 		 529 aa  176  9e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0837  sensor histidine kinase  26.03 
 
 		 529 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3910  sensory histidine kinase DcuS  26.98 
 
 		 537 aa  176  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0470  sensor histidine kinase  25.57 
 
 		 536 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398861  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2441  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.02 
 
 		 540 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3238  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.65 
 
 		 539 aa  173  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.698752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3300  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.65 
 
 		 539 aa  173  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.814205  hitchhiker  0.00983464 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3249  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.65 
 
 		 539 aa  173  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.710576  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0470  sensor histidine kinase  25.38 
 
 		 536 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.974367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0688  sensor histidine kinase  25.78 
 
 		 534 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3503  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.86 
 
 		 546 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243231 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3378  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.97 
 
 		 545 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.960766  normal  0.505448 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0615  sensor histidine kinase  25.38 
 
 		 534 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003319  sensor kinase CitA  28.34 
 
 		 539 aa  170  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0595  sensor protein CitS  25.79 
 
 		 533 aa  170  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0670  sensor histidine kinase DpiB  27.22 
 
 		 552 aa  170  7e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0246714  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3006  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.22 
 
 		 552 aa  169  8e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0642  sensor histidine kinase DpiB  27.22 
 
 		 552 aa  169  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0459667  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00589  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with citB  27.22 
 
 		 552 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0472  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.78 
 
 		 532 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4311  sensory histidine kinase DcuS  27.51 
 
 		 533 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412968  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3025  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.54 
 
 		 552 aa  169  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0707  sensor histidine kinase DpiB  27.58 
 
 		 552 aa  169  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0638  sensor histidine kinase DpiB  27.7 
 
 		 552 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.736103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4744  sensor protein CitS  26.37 
 
 		 533 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0834  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.33 
 
 		 540 aa  167  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0952704  normal  0.0982471 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0620  sensor histidine kinase  26.99 
 
 		 536 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2898  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.96 
 
 		 553 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1377  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.8 
 
 		 525 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0511  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  39.32 
 
 		 521 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0671541  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0876  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.99 
 
 		 537 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1350  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.8 
 
 		 543 aa  162  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3432  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.67 
 
 		 537 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2325  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.88 
 
 		 531 aa  162  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.18048  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3003  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.45 
 
 		 503 aa  162  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0343689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>