28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0032 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0032  transcription factor TFIIE, alpha subunit  100 
 
 
170 aa  343  5e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00767088 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1074  transcription factor TFIIE, alpha subunit  90 
 
 
170 aa  322  2e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0035  transcription factor TFIIE, alpha subunit  78.82 
 
 
170 aa  295  2e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2147  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  76.47 
 
 
170 aa  272  2e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1388  transcription factor TFIIE, alpha subunit  31.95 
 
 
183 aa  87.8  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299499  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0710  transcription factor TFIIE, alpha subunit  31.97 
 
 
178 aa  73.2  2e-12  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2279  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  31.71 
 
 
176 aa  66.2  2e-10  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.933385 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1244  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  27.64 
 
 
178 aa  63.9  1e-09  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1033  transcription initiation factor E subunit alpha  24.64 
 
 
185 aa  51.6  5e-06  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0285  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  27.35 
 
 
174 aa  49.3  2e-05  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.137025  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1033  transcription initiation factor E subunit alpha  23.62 
 
 
185 aa  49.7  2e-05  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0325255 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1650  transcription factor TFIIE, alpha subunit  24.24 
 
 
167 aa  48.9  3e-05  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0913  transcription initiation factor E subunit alpha  22.76 
 
 
185 aa  48.9  4e-05  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1150  transcription initiation factor E subunit alpha  25.2 
 
 
183 aa  48.1  5e-05  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2330  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  25 
 
 
179 aa  48.5  5e-05  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.373955 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1644  transcription initiation factor E subunit alpha  23.08 
 
 
185 aa  48.1  5e-05  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.275573  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1524  transcription factor TFIIE, alpha subunit  22.81 
 
 
173 aa  48.5  5e-05  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0458  hypothetical protein  23.68 
 
 
211 aa  47.8  8e-05  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0196  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  23.66 
 
 
164 aa  47.4  8e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0965  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  25.45 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1279  transcription factor TFIIE, alpha subunit  28.89 
 
 
173 aa  46.6  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.11333 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3157  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  24.11 
 
 
178 aa  45.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.484396  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1607  transcription factor TFIIE subunit alpha  25.97 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2797  transcription factor TFIIE, alpha subunit  22.76 
 
 
173 aa  42.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0975699 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1708  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  25.56 
 
 
174 aa  42.4  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0372  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  21.05 
 
 
165 aa  41.2  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  1.42035e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3982  RND family efflux transporter MFP subunit  40 
 
 
500 aa  41.2  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3782  RND family efflux transporter MFP subunit  38.89 
 
 
502 aa  40.4  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>