More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0958 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0958  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  311  2.9999999999999996e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0620  Enoyl-CoA hydratase  64.24 
 
 
151 aa  206  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16780  acyl dehydratase  59.33 
 
 
153 aa  186  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3534  dehydratase  56.29 
 
 
150 aa  180  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0316427  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1474  Enoyl-CoA hydratase  58 
 
 
150 aa  179  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.118864  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0231  Enoyl-CoA hydratase  55.63 
 
 
156 aa  174  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.460096  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1858  Enoyl-CoA hydratase  59.57 
 
 
150 aa  170  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0758  Enoyl-CoA hydratase  52.35 
 
 
151 aa  169  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10131  hypothetical protein  55.1 
 
 
151 aa  163  8e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0126  enoyl-CoA hydratase  54.97 
 
 
152 aa  163  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.787557 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1970  dehydratase  52.74 
 
 
168 aa  161  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1732  dehydratase  53.42 
 
 
150 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1751  MaoC-like dehydratase  53.42 
 
 
150 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0260343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1798  dehydratase  53.42 
 
 
150 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4374  dehydratase  52.05 
 
 
150 aa  158  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1606  MaoC domain protein dehydratase  49.67 
 
 
153 aa  155  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00168031  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3967  Enoyl-CoA hydratase  55.97 
 
 
150 aa  156  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0649  dehydratase  54.17 
 
 
150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870667  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5106  MaoC domain protein dehydratase  50 
 
 
151 aa  150  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3913  dehydratase  51.7 
 
 
155 aa  151  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.834878 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11910  hypothetical protein  50.34 
 
 
151 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0480105  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1094  hypothetical protein  49.66 
 
 
151 aa  148  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00316443  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1649  dehydratase  54.93 
 
 
152 aa  147  7e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.195889  normal  0.818072 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4397  Enoyl-CoA hydratase  50.68 
 
 
156 aa  146  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.124915  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1240  MaoC-like dehydratase  51.7 
 
 
151 aa  146  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0873  dehydratase  50.66 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.942848  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5858  Enoyl-CoA hydratase  52.14 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1571  MaoC-like dehydratase  49.66 
 
 
151 aa  145  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745995  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3810  dehydratase  48.3 
 
 
151 aa  144  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.511193  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2865  MaoC domain protein dehydratase  51.7 
 
 
154 aa  144  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3542  dehydratase  51.7 
 
 
154 aa  144  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249492  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1668  dehydratase  49.32 
 
 
194 aa  143  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4870  dehydratase  49.66 
 
 
151 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4817  MaoC domain-containing protein  50.69 
 
 
151 aa  143  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3821  dehydratase  50 
 
 
151 aa  143  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4692  dehydratase  50.69 
 
 
151 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4903  MaoC domain protein dehydratase  51.37 
 
 
151 aa  142  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134263  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3764  dehydratase  47.89 
 
 
152 aa  142  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.51064  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4641  MaoC domain protein dehydratase  50.67 
 
 
152 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00972568  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4982  MaoC-like dehydratase  48.3 
 
 
151 aa  141  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310652  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0438  dehydratase  50.68 
 
 
164 aa  141  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.15838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0604  dehydratase  47.62 
 
 
151 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1676  MaoC-like dehydratase  45.95 
 
 
151 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.633015  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4109  dehydratase  54.07 
 
 
152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202946  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0839  MaoC domain protein dehydratase  48.94 
 
 
153 aa  138  3e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.952766  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0846  dehydratase  48.32 
 
 
150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4135  dehydratase  51.35 
 
 
155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.5486  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1444  MaoC-like dehydratase  48.63 
 
 
162 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0821742  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3635  dehydratase  47.55 
 
 
158 aa  137  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.657671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2161  MaoC-like dehydratase  51.43 
 
 
152 aa  137  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0601335  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3583  nodN-like protein  46.53 
 
 
159 aa  137  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.234832 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2169  dehydratase  46.67 
 
 
161 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1612  enoyl-CoA hydratase  51.03 
 
 
152 aa  135  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1389  MaoC-like dehydratase  48.55 
 
 
154 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491643  normal  0.42325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2586  dehydratase  49.33 
 
 
152 aa  135  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.945813  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0635  MaoC-like dehydratase  50 
 
 
151 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0734  MaoC-like domain protein  47.62 
 
 
151 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0917658  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0947  MaoC-like dehydratase  46.75 
 
 
157 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3837  MaoC-like dehydratase  49.66 
 
 
151 aa  134  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101084  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1871  MaoC domain protein dehydratase  46.15 
 
 
159 aa  134  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.544936  normal  0.36 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0296  Enoyl-CoA hydratase  47.52 
 
 
153 aa  134  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.697257  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2194  MaoC domain protein dehydratase  46.15 
 
 
159 aa  133  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.302832 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1346  dehydratase  47.02 
 
 
148 aa  133  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0981  MaoC-like dehydratase  46.15 
 
 
158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.34044  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2479  MaoC domain protein dehydratase  47.26 
 
 
155 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3089  MaoC-like dehydratase  47.92 
 
 
160 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.767095  normal  0.110769 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1152  hypothetical protein  47.95 
 
 
150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2249  MaoC-like dehydratase  48.18 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.135818 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7557  MaoC-like dehydratase  49.65 
 
 
178 aa  128  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221212  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5640  Enoyl-CoA hydratase  44 
 
 
151 aa  128  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4112  Enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
161 aa  127  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0069293  normal  0.0412818 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2065  dehydratase  52.71 
 
 
153 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3180  MaoC-like dehydratase  44.44 
 
 
153 aa  126  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2402  MaoC-like dehydratase  46.31 
 
 
152 aa  125  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18064  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2042  hypothetical protein  44.65 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3206  MaoC-like dehydratase  46.72 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1690  MaoC-like dehydratase  42.34 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1577  dehydratase  48.3 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0775031  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4259  MaoC domain protein dehydratase  42.86 
 
 
157 aa  125  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.358063  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3353  MaoC domain protein dehydratase  43.54 
 
 
161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2745  dehydratase  50.38 
 
 
162 aa  123  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0292  Enoyl-CoA hydratase  44.78 
 
 
162 aa  122  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000103389  hitchhiker  0.0000892169 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4909  Enoyl-CoA hydratase  45.26 
 
 
163 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4012  Enoyl-CoA hydratase  43.15 
 
 
160 aa  121  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3655  MaoC domain protein dehydratase  45.99 
 
 
162 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0104771  normal  0.224277 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2554  MaoC-like dehydratase  43.45 
 
 
159 aa  120  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.98648  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1081  MaoC family protein  47.3 
 
 
160 aa  120  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1034  dehydratase  44.52 
 
 
151 aa  120  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248212  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2139  MaoC-like dehydratase  45.32 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1389  dehydratase  46.05 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2724  Enoyl-CoA hydratase  47.45 
 
 
160 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0179226  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0237  MaoC-like domain-containing protein  45.7 
 
 
158 aa  118  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5029  MaoC domain protein dehydratase  42.96 
 
 
166 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1105  nodulation protein N  49.62 
 
 
159 aa  118  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1310  MaoC domain-containing protein  46.62 
 
 
160 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3765  nodulation protein N  47.18 
 
 
162 aa  117  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1809  MaoC family protein  46.62 
 
 
160 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0345748  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0433  MaoC family protein  46.62 
 
 
160 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1150  MaoC family protein  46.62 
 
 
160 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1456  MaoC-like domain-containing protein  46.62 
 
 
160 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>