70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4140 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4140  nitrogen fixation protein NifX  100 
 
 		 139 aa  286  5.0000000000000004e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.480569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3934  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  56.92 
 
 		 137 aa  156  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0518816 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1348  nitrogen fixation protein NifX  58.4 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802033  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2114  nitrogen fixation protein NifX  53.49 
 
 		 136 aa  150  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0083007 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4798  nitrogen fixation protein NifX  53.97 
 
 		 138 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4252  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  52.63 
 
 		 134 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1818  nitrogen fixation protein NifX  51.09 
 
 		 135 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1790  nitrogen fixation protein NifX  51.09 
 
 		 135 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4458  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  50.36 
 
 		 135 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0460  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  41.72 
 
 		 168 aa  124  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5920  nitrogenase molybdenum-iron protein nifX  46.62 
 
 		 131 aa  125  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1472  nitrogen fixation-related protein (NifX)  45.32 
 
 		 137 aa  123  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437364  decreased coverage  0.0000979183 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1351  nitrogen fixation protein NifX  48.06 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2101  nitrogen fixation protein NifX  48.41 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0235  nitrogenase molybdenum-iron protein NifX  45.38 
 
 		 141 aa  120  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00441901  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2323  nitrogen fixation protein NifX  43.88 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0653956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0478  nitrogen fixation protein NifX  46.15 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1515  nitrogen fixation protein NifX  45.74 
 
 		 138 aa  117  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19909  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1233  nitrogen fixation protein NifX  45.74 
 
 		 138 aa  117  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000802968 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0093  nitrogen fixation protein NifX  41.35 
 
 		 131 aa  117  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.071454  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7731  nitrogen fixation protein NifX  42.96 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4052  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  44.2 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0671  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  43.61 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.551037 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3627  nitrogen fixation protein NifX  42.11 
 
 		 133 aa  110  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184482 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1078  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  42.34 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0974  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  41.61 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649686  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2284  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  41.09 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2805  nitrogenase molybdenum-iron cofactor biosynthesis protein NifX  42.86 
 
 		 129 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5096  nitrogen fixation protein NifX  41.61 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0634  nitrogen fixation protein NifX  39.68 
 
 		 128 aa  103  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1202  nitrogen fixation protein NifX  42.19 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120985  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3490  nitrogen fixation protein NifX  40.48 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2078  nitrogen fixation protein NifX  38.89 
 
 		 129 aa  99.4  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3539  nitrogen fixation protein NifX  35.42 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.89885  decreased coverage  0.00377232 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2140  nitrogen fixation protein NifX  37.12 
 
 		 129 aa  97.4  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0156404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3991  nitrogen fixation protein NifX  37.1 
 
 		 163 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370272  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1251  nitrogen fixation protein NifX  34.62 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1565  nitrogen fixation protein NifX  33.81 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0536  putative nitrogenase molybdenum-iron protein NifX  34.59 
 
 		 158 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.697848  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3026  nitrogen fixation protein NifX  34.68 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2188  nitrogen fixation protein NifX  34.59 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.141271 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4483  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  36.8 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6876  nitrogen fixation protein NifX  35.94 
 
 		 148 aa  93.6  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6221  nitrogen fixation protein NifX  31.91 
 
 		 165 aa  88.6  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.550036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1058  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.33 
 
 		 128 aa  87.8  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01480  Nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifX  37.12 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0270  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  28.46 
 
 		 247 aa  73.9  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1198  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.11 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.127129  hitchhiker  0.000500892 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0265  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  31.2 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3207  nitrogen fixation protein NifX  34.35 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50910  Nitrogen fixation-related protein, gamma subunit  30.83 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0585445  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1193  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.14 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000688158 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1054  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.62 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1410  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  35 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01420  Nitrogenase iron molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.61 
 
 		 242 aa  64.3  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1506  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  33.8 
 
 		 159 aa  63.5  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0495  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.4 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02570  nitrogen fixation-related protein, vnfY  25.53 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0717484  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1455  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  27.82 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0499  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.11 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1036  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.67 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0058  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.38 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0199747  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02740  nitrogenase biosynthetic protein vnfX  24.66 
 
 		 182 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48700  Metallocluster binding protein of the NafY/NifY/NifX/VnfX family  28.07 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1567  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  29.36 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1538  hypothetical protein  27.41 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3646  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  27.27 
 
 		 519 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  27.08 
 
 		 520 aa  41.2  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0105  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.61 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.314032  normal  0.119899 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1796  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.61 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.893199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>