18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1538 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1538  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  321  3e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0235  nitrogenase molybdenum-iron protein NifX  31.3 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00441901  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4458  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  28.7 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3026  nitrogen fixation protein NifX  28.07 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1036  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.3 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2101  nitrogen fixation protein NifX  23.68 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1818  nitrogen fixation protein NifX  28.36 
 
 		 135 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3207  nitrogen fixation protein NifX  33.63 
 
 		 127 aa  44.7  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1790  nitrogen fixation protein NifX  28.36 
 
 		 135 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1078  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  28.7 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4140  nitrogen fixation protein NifX  27.41 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.480569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0478  nitrogen fixation protein NifX  26.89 
 
 		 134 aa  43.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1351  nitrogen fixation protein NifX  24.24 
 
 		 143 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2114  nitrogen fixation protein NifX  26.5 
 
 		 136 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0083007 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1233  nitrogen fixation protein NifX  27.59 
 
 		 138 aa  41.2  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000802968 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1515  nitrogen fixation protein NifX  27.59 
 
 		 138 aa  41.2  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19909  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3934  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  25.64 
 
 		 137 aa  41.2  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0518816 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3627  nitrogen fixation protein NifX  25.42 
 
 		 133 aa  40.8  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184482 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>