98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0171 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0171  YeeE/YedE  100 
 
 		 162 aa  324  3e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.96637  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1366  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.12 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0269  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.46 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0624  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.29 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3682  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  29.65 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2310  YeeE/YedE family protein  31.95 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2678  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.46 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.782906  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1978  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.45 
 
 		 174 aa  62  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.248725  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2856  hypothetical protein  29.24 
 
 		 175 aa  60.8  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3116  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.81 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2608  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.08 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1878  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.85 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.658364  hitchhiker  0.00627314 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4882  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.74 
 
 		 187 aa  57  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437819  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.2 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3331  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.46 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286233  hitchhiker  0.0021122 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2997  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.33 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.55 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0175  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.45 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121367 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6934  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.14 
 
 		 191 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0801  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.38 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.897087  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2820  YeeE/YedE  29.93 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11778  hypothetical protein  31.07 
 
 		 185 aa  52.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1629  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.35 
 
 		 175 aa  52.4  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.301211 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2969  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.22 
 
 		 172 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000102  DUF395 domain-containing protein  31.65 
 
 		 139 aa  51.2  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268388  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00084  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.41 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2177  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.67 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.385456  normal  0.163167 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5568  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.21 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12633  hypothetical protein  30.39 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.318164  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1463  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.17 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4036  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.04 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2107  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.36 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3555  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.04 
 
 		 127 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1597  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.05 
 
 		 170 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1883  YeeE/YedE family membrane protein  33.62 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1168  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.58 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.709858  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2895  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.48 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.958182  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2497  integral membrane protein  26.92 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  29.03 
 
 		 359 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  29.03 
 
 		 359 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1302  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.58 
 
 		 141 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3387  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.54 
 
 		 184 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.487113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1868  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  23.81 
 
 		 180 aa  45.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3368  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.29 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0969639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3904  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.91 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.110227  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  34.95 
 
 		 344 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.95 
 
 		 352 aa  45.1  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0938  YeeE/YedE family protein  31.82 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0444  YeeE/YedE family protein  31.82 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0203  YeeE/YedE family protein  31.82 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1403  YeeE/YedE family protein  31.82 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.14374  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0760  hypothetical protein  28.67 
 
 		 145 aa  44.7  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0191  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34 
 
 		 145 aa  44.7  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  30.46 
 
 		 344 aa  44.7  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1143  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.58 
 
 		 141 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0770197  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0855  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.33 
 
 		 142 aa  44.3  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000829035 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1335  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.46 
 
 		 143 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000842724 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3632  hypothetical protein  29.14 
 
 		 140 aa  43.9  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0585  hypothetical protein  27.78 
 
 		 139 aa  43.9  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0742  hypothetical protein  28 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2077  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.15 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0104  hypothetical protein  31.61 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.313018 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5603  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.62 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1835  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.59 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4308  hypothetical protein  27.65 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1743  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.65 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.160283 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6793  hypothetical protein  43.55 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320556 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1028  hypothetical protein  28.9 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.637792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2075  hypothetical protein  43.75 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.718752  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1997  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.75 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765008  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0178  hypothetical protein  32 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0891988 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1716  YeeE/YedE  42.31 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.539971  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1026  putative transmembrane protein  33.05 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304948  normal  0.155882 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1618  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  45.83 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000269171  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5807  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.11 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0641705  normal  0.400068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0118  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.91 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.115789 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05709  hypothetical protein  24.53 
 
 		 133 aa  42.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.18 
 
 		 330 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2899  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.27 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2350  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.07 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0788  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.25 
 
 		 175 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0768937  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4146  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.19 
 
 		 141 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0812  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.48 
 
 		 145 aa  42  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.938577  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2718  hypothetical protein  32.71 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.814513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3703  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.75 
 
 		 185 aa  41.6  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4076  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.17 
 
 		 143 aa  41.6  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0200066  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2596  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.08 
 
 		 171 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02370  conserved hypothetical protein  39.22 
 
 		 348 aa  40.8  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.621696  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4624  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  45.83 
 
 		 141 aa  40.8  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1570  hypothetical protein  35.19 
 
 		 136 aa  40.8  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0512  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28 
 
 		 176 aa  40.8  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1493  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.44 
 
 		 145 aa  40.8  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1813  YeeE/YedE family protein  30.91 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1899  YeeE/YedE family protein  30.91 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279304  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  34.07 
 
 		 385 aa  40.4  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0358  YeeE/YedE family protein  30.91 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5675  putative transporter component domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1086  YeeE/YedE family protein  30 
 
 		 144 aa  40.4  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>