46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1268 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1268  peptidase S51 dipeptidase E  100 
 
 
248 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.186811  normal  0.51146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2642  hypothetical protein  85.31 
 
 
245 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100609  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3095  peptidase S51 dipeptidase E  67.89 
 
 
245 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277898  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3365  peptidase S51 dipeptidase E  55.07 
 
 
244 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225018  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3137  peptidase S51, dipeptidase E  50.62 
 
 
254 aa  218  7.999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.638284  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1776  peptidase S51 dipeptidase E  52.08 
 
 
280 aa  217  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125751  normal  0.183168 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3782  peptidase S51, dipeptidase E  47.23 
 
 
243 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3283  peptidase S51 dipeptidase E  49.75 
 
 
243 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.413219  normal  0.0948111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1273  peptidase S51 dipeptidase E  47.6 
 
 
241 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1620  peptidase S51 dipeptidase E  45.96 
 
 
243 aa  185  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.511149  normal  0.556978 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0136  peptidase S51, dipeptidase E  43.03 
 
 
247 aa  185  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4161  peptidase S51 dipeptidase E  52 
 
 
243 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000119415 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02370  peptidase E  46.15 
 
 
247 aa  164  8e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.946739  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18450  peptidase E  45.1 
 
 
250 aa  159  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17206  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0201  peptidase S51 dipeptidase E  41.67 
 
 
249 aa  156  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0200  peptidase S51 dipeptidase E  44.17 
 
 
262 aa  155  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1676  peptidase S51 dipeptidase E  40.5 
 
 
194 aa  141  9e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00740  peptidase E  45.83 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2070  peptidase S51, dipeptidase E  29.34 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10841  hypothetical protein  30.73 
 
 
230 aa  126  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.103566  hitchhiker  0.00469942 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0394  hypothetical protein  30.24 
 
 
230 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.106311  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10721  peptidase E  31 
 
 
226 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1000  hypothetical protein  30.69 
 
 
226 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0358258  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10751  peptidase E  29.7 
 
 
226 aa  115  5e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.293161  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10751  peptidase E  28.71 
 
 
226 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.439295  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1748  peptidase S51 dipeptidase E  36.44 
 
 
201 aa  103  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02569  peptidase E  32.6 
 
 
207 aa  99.4  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2319  peptidase S51, dipeptidase E  30.17 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1900  hypothetical protein  25.12 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000489032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1847  hypothetical protein  25.12 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174476  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1824  hypothetical protein  25.12 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1643  hypothetical protein  25.12 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1622  peptidase E  25.12 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1774  hypothetical protein  25.12 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1592  peptidase E  25.12 
 
 
232 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1788  hypothetical protein  25.73 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3556  hypothetical protein  25.73 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.230544  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1642  peptidase S51 dipeptidase E  24.24 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.5501  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1420  peptidase S51 dipeptidase E  23.41 
 
 
232 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2399  cyanophycinase  21.6 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2771  peptidase E  26.5 
 
 
247 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000609808  decreased coverage  0.00176769 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37460  predicted protein  29.3 
 
 
211 aa  45.4  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0054  cyanophycinase  22.65 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2205  cyanophycinase  21.9 
 
 
269 aa  43.5  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4859  cyanophycinase  25.94 
 
 
327 aa  42.7  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.600302 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0172  cyanophycinase  28.83 
 
 
278 aa  42.4  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0803268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>