46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1651 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1651  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  375  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000844745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0060  phosphodiesterase, MJ0936 family  54.24 
 
 		 178 aa  197  5e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.876718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0341  phosphodiesterase, MJ0936 family  50 
 
 		 171 aa  170  9e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.431716  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2678  phosphodiesterase  38.1 
 
 		 162 aa  96.7  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2746  phosphodiesterase  38.1 
 
 		 176 aa  95.9  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0024  phosphodiesterase  35.12 
 
 		 163 aa  92.8  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0201  phosphodiesterase  30.29 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.605154  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1362  phosphodiesterase  30.95 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  28.65 
 
 		 173 aa  72  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.56 
 
 		 162 aa  72  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0138  hypothetical protein  28.24 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.68 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0908  phosphodiesterase  31.98 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.808433  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0718  phosphodiesterase  32.39 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.205538  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  26.67 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  30.23 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0694  phosphodiesterase  32.39 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2093  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.253727  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0026  phosphodiesterase  27.11 
 
 		 158 aa  67.4  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0763  phosphodiesterase  31.79 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.420804  normal  0.111199 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0099  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.76 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3652  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.86 
 
 		 166 aa  64.3  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0185  phosphodiesterase  27.38 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2220  phosphodiesterase  29.07 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0660952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  29.24 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1432  phosphodiesterase  28.07 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0917348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.82 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  25.17 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  28.77 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  28.1 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  34.23 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  24.53 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  24.22 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  24.53 
 
 		 171 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1906  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.07 
 
 		 184 aa  52.4  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  29.25 
 
 		 151 aa  45.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  44.44 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.04 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1399  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.9 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.66731  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  26.59 
 
 		 148 aa  42.4  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3490  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  34.83 
 
 		 251 aa  42  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0205997  normal  0.185531 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  28.97 
 
 		 162 aa  42  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3115  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.54 
 
 		 247 aa  42  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.074661  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  23.43 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  30.34 
 
 		 152 aa  41.6  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  29.52 
 
 		 177 aa  41.2  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>