More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1721 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1648  adenylosuccinate lyase  97.91 
 
 		 431 aa  868    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1721  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 431 aa  883    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1243  adenylosuccinate lyase  60.32 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0219  adenylosuccinate lyase  57.67 
 
 		 432 aa  522  1e-147  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1648  adenylosuccinate lyase  55.45 
 
 		 431 aa  520  1e-146  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  55.37 
 
 		 430 aa  491  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  53.97 
 
 		 431 aa  482  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  52.22 
 
 		 431 aa  482  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  52.93 
 
 		 431 aa  478  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  51.99 
 
 		 431 aa  477  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  52.22 
 
 		 431 aa  478  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  53.83 
 
 		 438 aa  477  1e-133  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  52.69 
 
 		 431 aa  478  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  52.22 
 
 		 431 aa  478  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  51.4 
 
 		 431 aa  472  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  51.29 
 
 		 431 aa  472  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  51.17 
 
 		 430 aa  471  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1014  adenylosuccinate lyase  51.98 
 
 		 437 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  53.5 
 
 		 431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  49.3 
 
 		 430 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  51.99 
 
 		 431 aa  464  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  50.82 
 
 		 451 aa  458  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  50.59 
 
 		 431 aa  461  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  50.59 
 
 		 451 aa  458  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  51.99 
 
 		 431 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  52.56 
 
 		 435 aa  458  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  49.88 
 
 		 434 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  50.35 
 
 		 451 aa  455  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  51.64 
 
 		 432 aa  456  1e-127  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  50.93 
 
 		 435 aa  455  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  50.93 
 
 		 435 aa  456  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  50.7 
 
 		 432 aa  458  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  51.17 
 
 		 430 aa  456  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  50.7 
 
 		 435 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  51.95 
 
 		 445 aa  454  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_002978  WD0786  adenylosuccinate lyase  50.12 
 
 		 430 aa  451  1.0000000000000001e-126  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0346499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  50.7 
 
 		 435 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  50.7 
 
 		 435 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  50.7 
 
 		 435 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  50.7 
 
 		 435 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0136  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 		 431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000687142  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  52.33 
 
 		 435 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  50.7 
 
 		 435 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  50.7 
 
 		 433 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  50.7 
 
 		 435 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  50.7 
 
 		 435 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  51.05 
 
 		 431 aa  448  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1011  adenylosuccinate lyase  50.7 
 
 		 431 aa  449  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  50 
 
 		 435 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 		 435 aa  448  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  50.7 
 
 		 434 aa  451  1e-125  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1526  adenylosuccinate lyase  50.95 
 
 		 425 aa  450  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  50.82 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  50 
 
 		 435 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  50.23 
 
 		 435 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1446  adenylosuccinate lyase  51.86 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000278594  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  51.86 
 
 		 435 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4928  adenylosuccinate lyase  49.07 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000014766  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0095  adenylosuccinate lyase  49.65 
 
 		 436 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  50.35 
 
 		 432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1894  adenylosuccinate lyase  49.43 
 
 		 443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  49.65 
 
 		 431 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2464  adenylosuccinate lyase  49.88 
 
 		 438 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.495777  hitchhiker  0.00480262 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  50.12 
 
 		 431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  48.83 
 
 		 430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  50.35 
 
 		 431 aa  444  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  48.15 
 
 		 432 aa  444  1e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0992  adenylosuccinate lyase  51.74 
 
 		 435 aa  443  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1307  adenylosuccinate lyase  50.47 
 
 		 427 aa  442  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.325105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0391  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 		 431 aa  442  1e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000515092 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0426  adenylosuccinate lyase  48.01 
 
 		 430 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1990  adenylosuccinate lyase  50.59 
 
 		 435 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1121  adenylosuccinate lyase  48.52 
 
 		 447 aa  438  9.999999999999999e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3011  adenylosuccinate lyase  48.95 
 
 		 431 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  49.65 
 
 		 431 aa  440  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1819  adenylosuccinate lyase  48.42 
 
 		 442 aa  440  9.999999999999999e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2356  adenylosuccinate lyase  50.59 
 
 		 435 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0023  adenylosuccinate lyase  49.43 
 
 		 442 aa  436  1e-121  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  48.48 
 
 		 431 aa  435  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0991  adenylosuccinate lyase  48.96 
 
 		 434 aa  437  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0025  adenylosuccinate lyase  49.2 
 
 		 442 aa  435  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  48.25 
 
 		 431 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0050  adenylosuccinate lyase  49.2 
 
 		 442 aa  437  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2417  adenylosuccinate lyase  50 
 
 		 433 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12659  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  47.2 
 
 		 430 aa  435  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  50.7 
 
 		 435 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  48.48 
 
 		 431 aa  435  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 		 433 aa  435  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7577  adenylosuccinate lyase  50.7 
 
 		 435 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6842  adenylosuccinate lyase  50.47 
 
 		 435 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  47.2 
 
 		 433 aa  433  1e-120  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  48.48 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1309  adenylosuccinate lyase  51.27 
 
 		 438 aa  434  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.244408  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  50.7 
 
 		 434 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1468  adenylosuccinate lyase  48.24 
 
 		 432 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1390  adenylosuccinate lyase  48.01 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.98811  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  50.82 
 
 		 437 aa  433  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1108  adenylosuccinate lyase  48.72 
 
 		 434 aa  432  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.34197  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 		 438 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>