15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0018 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0018  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  684    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0178486  normal  0.948027 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0220  hypothetical protein  67.38 
 
 		 336 aa  468  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3579  hypothetical protein  61.76 
 
 		 338 aa  433  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.512655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2294  hypothetical protein  62.5 
 
 		 341 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0157947  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0017  hypothetical protein  46.96 
 
 		 353 aa  299  4e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.129406  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3140  hypothetical protein  39.63 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.999402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3412  hypothetical protein  40.61 
 
 		 340 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0402  hypothetical protein  39.55 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2758  hypothetical protein  33.24 
 
 		 348 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1859  hypothetical protein  31.48 
 
 		 323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.174959  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0413  hypothetical protein  32.88 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1816  hypothetical protein  28.99 
 
 		 600 aa  52.8  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.122136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1056  hypothetical protein  30.23 
 
 		 416 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496515  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0541  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 		 416 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0499  hypothetical protein  28.3 
 
 		 333 aa  43.5  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>