48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2841 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2841  protein of unknown function DUF559  100 
 
 		 148 aa  295  2e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00016732  normal  0.493476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1233  hypothetical protein  43.84 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0114459  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5155  protein of unknown function DUF559  32.91 
 
 		 311 aa  57  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2516  hypothetical protein  39.71 
 
 		 316 aa  57  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0713675  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5265  hypothetical protein  36.67 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1053  protein of unknown function DUF559  43.14 
 
 		 270 aa  52.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.261729 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0914  hypothetical protein  31.68 
 
 		 316 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3303  hypothetical protein  34.38 
 
 		 279 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  35.14 
 
 		 306 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1182  hypothetical protein  30.48 
 
 		 327 aa  50.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3899  hypothetical protein  33.33 
 
 		 289 aa  50.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  32.81 
 
 		 259 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1560  hypothetical protein  39.58 
 
 		 304 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426763  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1827  hypothetical protein  28.99 
 
 		 331 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.14041  normal  0.116038 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5112  hypothetical protein  41.54 
 
 		 329 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146681 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5388  hypothetical protein  42.31 
 
 		 242 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5477  hypothetical protein  39.68 
 
 		 285 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0193619  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  29.87 
 
 		 294 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5764  hypothetical protein  39.68 
 
 		 285 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1486  hypothetical protein  34.91 
 
 		 705 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0966  hypothetical protein  35.71 
 
 		 275 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0405  hypothetical protein  33.63 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2722  hypothetical protein  38.57 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  32.84 
 
 		 295 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1559  hypothetical protein  33.64 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0433  hypothetical protein  39.13 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0961  protein of unknown function DUF559  35.21 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2356  hypothetical protein  39.06 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0831458  normal  0.14274 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2475  hypothetical protein  30 
 
 		 277 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  35.29 
 
 		 925 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  35.94 
 
 		 357 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0647  hypothetical protein  33.64 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.177117 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0966  hypothetical protein  27.06 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1037  protein of unknown function DUF559  28 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1915  hypothetical protein  35.24 
 
 		 297 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3715  hypothetical protein  35.29 
 
 		 272 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  32.69 
 
 		 289 aa  41.2  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2274  protein of unknown function DUF559  32.84 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0690835  hitchhiker  0.00000422818 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2211  protein of unknown function DUF559  32.84 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  33.33 
 
 		 330 aa  40.8  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1099  hypothetical protein  45.24 
 
 		 306 aa  40.8  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.994405  hitchhiker  0.000237406 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1131  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.26 
 
 		 305 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428914 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  28.21 
 
 		 320 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  28.21 
 
 		 320 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  28.21 
 
 		 320 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4159  hypothetical protein  36.54 
 
 		 276 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00219007  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1578  hypothetical protein  37.93 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2629  hypothetical protein  32.41 
 
 		 388 aa  40.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>