21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1024 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1024  hypothetical protein  100 
 
 		 459 aa  942    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000932144  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2691  glutamate mutase, MutL  50.98 
 
 		 462 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4402  glutamate mutase, MutL  46.49 
 
 		 460 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15450  conserved hypothetical protein TIGR01319  47.96 
 
 		 464 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000232195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1346  glutamate mutase, MutL  41.48 
 
 		 461 aa  344  2e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21090  DNA mismatch repair protein MutL  37.96 
 
 		 447 aa  270  5.9999999999999995e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1171  putative component of D-ornithine aminomutase  35.5 
 
 		 456 aa  258  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333128  decreased coverage  0.0000285962 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1665  methylaspartate mutase  35.96 
 
 		 468 aa  254  3e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1816  methylaspartate mutase  34.43 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1482  hypothetical protein  35.37 
 
 		 447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000544917  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0316  hypothetical protein  35.84 
 
 		 455 aa  228  1e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3947  glutamate mutase large subunit, B12-dependent  33.33 
 
 		 454 aa  220  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0751  putative glutamate mutase mutL  32.48 
 
 		 462 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0831  putative glutamate mutase mutL  32.06 
 
 		 462 aa  212  9e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.937814 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2155  glutamate mutase, MutL  33.54 
 
 		 471 aa  195  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.932369 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2387  hypothetical protein  30.52 
 
 		 445 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030749  hitchhiker  0.000291133 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2268  hypothetical protein  30.97 
 
 		 469 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00276621  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0977  hypothetical protein  31.66 
 
 		 443 aa  162  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0781  hypothetical protein  29.08 
 
 		 613 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2217  hypothetical protein  22.5 
 
 		 676 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000677217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0192  hypothetical protein  24.08 
 
 		 725 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00309311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>