More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_R0028 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_R0028  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-2  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0970138  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0042  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0290864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0014  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0018085  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0004  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000171027  normal  0.958978 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAMetVIMSS1309108  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0032  tRNA-Met  94.67 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0013  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0011  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0024  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0052  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0029  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000365135 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0039  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0006  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.0000000000568844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0062  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0029  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0041  tRNA-Met  93.51 
 
 		 75 bp  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0070  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0078  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000612862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5720  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0159176  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-4  tRNA-Met  92.21 
 
 		 80 bp  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00179817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-5  tRNA-Met  92.21 
 
 		 80 bp  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.996221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-5  tRNA-Met  92.21 
 
 		 80 bp  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000520832  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0127  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00272429  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt41  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt41  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-6  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00021362  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0023  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22048  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0025  tRNA-Met  93.51 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4991  tRNA-Met  92.21 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0105  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0093247  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0090  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419074  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0057  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0070  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.734677  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0071  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957172  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0058  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263555  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5022  tRNA-Met  92.21 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00192595  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0060  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAMetVIMSS1309167  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0009  tRNA-Met  93.06 
 
 		 74 bp  103  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0050  tRNA-Met  92 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.540362  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_R0079  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0306  tRNA-Met  90.91 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0056  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5710  tRNA-Met  90.91 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000091391  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5678  tRNA-Met  90.91 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0075  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5667  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5675  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000376256  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5699  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000350684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-2  tRNA-Met  90.91 
 
 		 80 bp  97.6  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0182265  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5737  tRNA-Met  90.91 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000112746  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-7  tRNA-Met  90.91 
 
 		 80 bp  97.6  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-3  tRNA-Met  90.91 
 
 		 80 bp  97.6  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00436106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-4  tRNA-Met  90.91 
 
 		 80 bp  97.6  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-6  tRNA-Met  90.91 
 
 		 80 bp  97.6  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00001255  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-2  tRNA-Met  90.91 
 
 		 80 bp  97.6  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0383767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-3  tRNA-Met  90.91 
 
 		 80 bp  97.6  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000267735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-8  tRNA-Met  90.91 
 
 		 80 bp  97.6  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5807  tRNA-Met  90.91 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00231597  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0003  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00215026  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0043  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0021    90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.24709  hitchhiker  0.00028661 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0046  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0058  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.547375 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0018  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00237238  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0012  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0040  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.318814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0010  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0016  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-2  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.527253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-4  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000768608  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5667  tRNA-Met  90.91 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000879492  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0030  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0046  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0056  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0058  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000407746  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0011  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.903466 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0045  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0027  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0057  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.492622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0026  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0028  tRNA-Met  93.85 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00000000334964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0031  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0282  tRNA-Met  90.91 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0020  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4695  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0064  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00167035  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4694  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0064  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0048  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.816962 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0865  tRNA-Met  90.91 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000813952  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0024  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230769 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0019  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0790  tRNA-Met  90.91 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3991e-32 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAMetVIMSS1309196  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.868171  hitchhiker  0.00000970855 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAMetVIMSS1309263  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105935 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0013  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.0245771 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAMetVIMSS1309377  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.00798098  hitchhiker  0.0000123944 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0069  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00149713  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>