More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0390 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  100 
 
 		 383 aa  730    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  39.63 
 
 		 472 aa  258  9e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  39.95 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38.48 
 
 		 404 aa  235  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  42.14 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  42.14 
 
 		 387 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  36.91 
 
 		 395 aa  226  7e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  39.23 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  37.19 
 
 		 390 aa  223  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  36.63 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.46 
 
 		 392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  38.13 
 
 		 393 aa  219  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38 
 
 		 390 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  39.01 
 
 		 393 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  36.15 
 
 		 376 aa  213  4.9999999999999996e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  35.9 
 
 		 397 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  38.11 
 
 		 379 aa  213  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.71 
 
 		 390 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  38.32 
 
 		 401 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0723  chromate transporter  35.25 
 
 		 408 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.57 
 
 		 382 aa  209  7e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  37.46 
 
 		 401 aa  208  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11551  chromate transporter  34.3 
 
 		 412 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0167365 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  35.76 
 
 		 376 aa  207  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0443  chromate transporter  33.17 
 
 		 412 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  37.22 
 
 		 393 aa  206  4e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  38.84 
 
 		 401 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  39.83 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.06 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  41.57 
 
 		 376 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  35.28 
 
 		 396 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  35.28 
 
 		 396 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  35.28 
 
 		 396 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  31.42 
 
 		 420 aa  203  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  34.63 
 
 		 392 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  34.37 
 
 		 392 aa  202  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  34.65 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.1 
 
 		 472 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12381  chromate transporter  33.61 
 
 		 408 aa  199  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  36.45 
 
 		 398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  35.97 
 
 		 390 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  35.71 
 
 		 390 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  35.04 
 
 		 385 aa  194  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  35.71 
 
 		 390 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  34.15 
 
 		 399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.4 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  31.46 
 
 		 453 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  35.03 
 
 		 388 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  31.46 
 
 		 446 aa  180  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  31.06 
 
 		 416 aa  176  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  32.11 
 
 		 463 aa  172  6.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0081  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.13 
 
 		 450 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.826612 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  31.96 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  30.11 
 
 		 456 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  30.11 
 
 		 456 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.43 
 
 		 441 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0316  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.6 
 
 		 447 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.84 
 
 		 352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  28.65 
 
 		 454 aa  167  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  29.43 
 
 		 450 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  31.22 
 
 		 447 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4365  chromate transporter  30.22 
 
 		 455 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  32.73 
 
 		 428 aa  161  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  29.32 
 
 		 450 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  29.19 
 
 		 442 aa  160  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  32.05 
 
 		 397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0924  chromate transporter  33.75 
 
 		 358 aa  151  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.376436 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.73 
 
 		 469 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.44 
 
 		 441 aa  146  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  28.61 
 
 		 443 aa  146  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  30.12 
 
 		 393 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  30.73 
 
 		 456 aa  146  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4665  putative chromate transporter  28.69 
 
 		 463 aa  143  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4248  chromate transporter  28.69 
 
 		 450 aa  144  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2533  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  36.47 
 
 		 348 aa  143  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4736  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.06 
 
 		 471 aa  143  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4194  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29 
 
 		 469 aa  142  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1475  chromate transporter  27.91 
 
 		 467 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.215191 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  31.01 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1753  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.37 
 
 		 467 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5316  chromate ion transporter  30.05 
 
 		 393 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  27.32 
 
 		 483 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2446  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.03 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.853251  decreased coverage  0.0000000439073 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  28.86 
 
 		 417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  30.48 
 
 		 430 aa  137  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3583  chromate transporter  28.77 
 
 		 460 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35339  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3131  chromate transporter  27.68 
 
 		 454 aa  136  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3337  chromate transporter  27.68 
 
 		 454 aa  136  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  28.86 
 
 		 449 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1532  chromate transporter  27.49 
 
 		 452 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2538  chromate transporter  27.01 
 
 		 465 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1633  chromate transporter  28.73 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3651  chromate transporter  26.43 
 
 		 469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.947336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6162  chromate transporter  26.76 
 
 		 466 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5326  chromate ion transporter  29.37 
 
 		 393 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0300  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.4 
 
 		 467 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178358 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.27 
 
 		 469 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  48.12 
 
 		 391 aa  129  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  31.07 
 
 		 392 aa  129  6e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5054  chromate ion transporter  29.75 
 
 		 393 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>