38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0099 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0099  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  100 
 
 		 351 aa  711    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0171907  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  27.52 
 
 		 3301 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 3172 aa  77.8  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  26.54 
 
 		 979 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1493  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.09 
 
 		 630 aa  67.8  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.21852  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1492  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  22.89 
 
 		 374 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0925306  normal  0.0420453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1770  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.91 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1492  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.12 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2424  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  28.19 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.47686  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3122  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  22.12 
 
 		 595 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5188  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.23 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3255  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  19.91 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175633  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0427  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  27 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182451  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0161  hypothetical protein  24.2 
 
 		 349 aa  59.3  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4830  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  23.31 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal  0.375609 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4250  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.12 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.305989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0626  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  24.61 
 
 		 366 aa  57  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3672  hypothetical protein  21.29 
 
 		 434 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43765  normal  0.291983 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0382  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.3 
 
 		 844 aa  55.8  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.97387  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4682  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.03 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4313  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  23.61 
 
 		 414 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01531  hypothetical protein  25.89 
 
 		 380 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4960  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.81 
 
 		 399 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0854  capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.46 
 
 		 366 aa  53.1  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0933972  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0449  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.79 
 
 		 372 aa  52.8  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1287  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  30.34 
 
 		 493 aa  50.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3136  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  26.02 
 
 		 386 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3663  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  28 
 
 		 398 aa  50.1  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.87959 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1812  hypothetical protein  31.51 
 
 		 379 aa  50.1  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3098  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  25.81 
 
 		 418 aa  49.7  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1189  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  34.67 
 
 		 630 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.099685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2023  hypothetical protein  27.27 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.426657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3856  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  22.7 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.347338 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6880  hypothetical protein  27.84 
 
 		 383 aa  47  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1814  hypothetical protein  20.98 
 
 		 362 aa  46.6  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.506376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4387  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.71 
 
 		 440 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6825  hypothetical protein  31.82 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.626132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1193  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.79 
 
 		 505 aa  43.9  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>