138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0056 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0056  amidase enhancer  100 
 
 		 515 aa  1025    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.982033  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0059  amidase enhancer  65.13 
 
 		 519 aa  618  1e-176  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00621  putative amidase enhancer  57.31 
 
 		 527 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21291  putative amidase enhancer  48.54 
 
 		 517 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0680822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1258  putative amidase enhancer  48.12 
 
 		 517 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17861  putative amidase enhancer  49.66 
 
 		 457 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18501  putative amidase enhancer  36.34 
 
 		 511 aa  332  9e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18501  putative amidase enhancer  36.14 
 
 		 512 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18691  putative amidase enhancer  33.79 
 
 		 517 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.835573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1752  putative amidase enhancer  35.48 
 
 		 517 aa  313  5.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0712  SpoIID/LytB domain protein  33.91 
 
 		 586 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4505  SpoIID/LytB domain protein  31.98 
 
 		 537 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4443  SpoIID/LytB domain protein  31.98 
 
 		 537 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1045  amidase enhancer-like  36.16 
 
 		 523 aa  213  5.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.263222 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4348  SpoIID/LytB domain protein  32.49 
 
 		 530 aa  213  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0757  amidase enhancer  31.6 
 
 		 555 aa  206  7e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0918  SpoIID/LytB domain-containing protein  32.38 
 
 		 536 aa  202  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.478605  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0180  SpoIID/LytB domain-containing protein  32.18 
 
 		 533 aa  200  5e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2831  SpoIID/LytB domain protein  35.96 
 
 		 380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.835206  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2359  SpoIID/LytB domain-containing protein  36.46 
 
 		 421 aa  131  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000614702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4925  SpoIID/LytB domain protein  33.12 
 
 		 558 aa  127  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0278  SpoIID/LytB domain protein  32.79 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0960  SpoIID/LytB domain-containing protein  27.67 
 
 		 570 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000216534  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1608  SpoIID/LytB domain protein  30.89 
 
 		 363 aa  125  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2012  stage II sporulation protein D-like  31.4 
 
 		 407 aa  124  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.703242 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1362  SpoIID/LytB domain protein  30.72 
 
 		 382 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1392  SpoIID/LytB domain protein  30.72 
 
 		 382 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10950  SpoIID/LytB domain protein  30 
 
 		 708 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0118961  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2636  SpoIID/LytB domain-containing protein  34.45 
 
 		 675 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2743  SpoIID/LytB domain protein  35.74 
 
 		 612 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  29.97 
 
 		 625 aa  111  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2625  SpoIID/LytB domain protein  26.85 
 
 		 368 aa  111  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2838  SpoIID/LytB domain protein  35.41 
 
 		 616 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156879  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2653  sporulation protein, amidase enhancer  35.41 
 
 		 612 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0630  SpoIID/LytB domain protein  26.38 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5043  SpoIID/LytB domain protein  30.63 
 
 		 386 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14021  sporulation protein SpoIID  28.33 
 
 		 432 aa  107  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.388371  normal  0.301012 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2621  stage II sporulation-related protein  28.89 
 
 		 321 aa  105  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4218  sporulation protein SpoIID-like  30.23 
 
 		 384 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000195999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2013  SpoIID/LytB domain protein  27.01 
 
 		 376 aa  103  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.588704  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1785  sporulation protein and related proteins-like  28.95 
 
 		 526 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.450539  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0527  SpoIID/LytB domain protein  22.92 
 
 		 546 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000920143  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2616  SpoIID/LytB domain-containing protein  28.33 
 
 		 334 aa  101  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0850  stage II sporulation-related protein  27.3 
 
 		 376 aa  101  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1802  SpoIID/LytB domain-containing protein  28.57 
 
 		 378 aa  100  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.806202  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0117  SpoIID/LytB domain-containing protein  27.56 
 
 		 317 aa  100  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15341  sporulation protein SpoIID  27 
 
 		 391 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  unclonable  0.00436171  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4515  SpoIID/LytB domain-containing protein  28.34 
 
 		 381 aa  99  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1714  SpoIID/LytB domain-containing protein  28.62 
 
 		 369 aa  98.2  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151227  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0380  SpoIID/LytB domain-containing protein  32.08 
 
 		 686 aa  98.2  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000403516  hitchhiker  0.0000000000012381 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15491  sporulation protein SpoIID  29.05 
 
 		 391 aa  97.8  4e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1696  sporulation protein and related proteins-like  24.63 
 
 		 471 aa  96.7  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.600188 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2281  SpoIID/LytB domain-containing protein  28.4 
 
 		 563 aa  94.7  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00377918  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1794  SpoIID/LytB domain protein  22.22 
 
 		 720 aa  93.6  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160859 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1446  sporulation protein SpoIID-like  25.17 
 
 		 391 aa  90.9  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1767  SpoIID/LytB domain-containing protein  30.12 
 
 		 450 aa  90.9  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.312294 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0920  SpoIID/LytB domain protein  25.77 
 
 		 437 aa  90.5  6e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0663861  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0689  SpoIID/LytB domain-containing protein  25.17 
 
 		 326 aa  90.5  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.531894  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2187  SpoIID/LytB domain protein  28.94 
 
 		 454 aa  90.5  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2108  sporulation protein and related proteins  27.27 
 
 		 326 aa  89  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2376  stage II sporulation protein D  27.12 
 
 		 291 aa  88.6  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440786  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1118  SpoIID/LytB domain protein  25.27 
 
 		 463 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.819333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17760  sporulation stage II protein D  26.73 
 
 		 319 aa  88.2  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.377102  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0085  stage II sporulation protein D  30.92 
 
 		 314 aa  87.8  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.622828  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0506  SpoIID/LytB domain-containing protein  24.69 
 
 		 366 aa  87  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.133427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21150  SpoIID/LytB domain protein  24.73 
 
 		 316 aa  87  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000468923  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1405  SpoIID/LytB domain protein  31.6 
 
 		 291 aa  87  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15091  sporulation protein SpoIID  24.26 
 
 		 397 aa  86.7  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2545  stage II sporulation-related protein  31.6 
 
 		 291 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3325  SpoIID/LytB domain protein  29.72 
 
 		 377 aa  86.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0346902  normal  0.223607 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5407  stage II sporulation protein D  26.53 
 
 		 339 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0035  SpoIID/LytB domain-containing protein  27.91 
 
 		 508 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000486765  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0700  SpoIID/LytB domain-containing protein  27.19 
 
 		 503 aa  85.9  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1304  SpoIID/LytB domain protein  31.6 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430869  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1268  SpoIID/LytB domain-containing protein  27.76 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5543  stage II sporulation protein D  26.19 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00744425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0281  stage II sporulation protein D  24.92 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.213834  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0106  SpoIID/LytB domain-containing protein  26 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0244  SpoIID/LytB domain protein  27.71 
 
 		 584 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4968  stage II sporulation protein D  25.85 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0719716  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2144  stage II sporulation protein D-like  29.82 
 
 		 495 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0221  SpoIID/LytB domain protein  27.18 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000520867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3805  sporulation stage II protein D  26.53 
 
 		 337 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5377  stage II sporulation protein D  25.85 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000599037 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5084  sporulation stage II protein D  26.19 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2597  SpoIID/LytB domain protein  28.03 
 
 		 493 aa  81.3  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0642  SpoIID/LytB domain-containing protein  25.95 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0335731  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5136  stage II sporulation protein D  25.85 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5528  stage II sporulation protein D  25.85 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1780  SpoIID/LytB domain protein  26.86 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174571 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4986  stage II sporulation protein D  25.85 
 
 		 339 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.579357  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0919  sporulation protein SpoIID  26.02 
 
 		 405 aa  79.7  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0218  stage II sporulation protein D  27 
 
 		 358 aa  79.7  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5462  stage II sporulation protein D  25.85 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000156076  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17751  sporulation protein SpoIID  25.75 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3479  SpoIID/LytB domain-containing protein  24.73 
 
 		 852 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00505256  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5411  stage II sporulation protein D  25.85 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0080939  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0533  stage II sporulation protein D-like  28.38 
 
 		 489 aa  76.3  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3624  SpoIID/LytB domain protein  27.47 
 
 		 459 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000549962  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3287  stage II sporulation protein D  25.85 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>