43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3851 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3851  membrane lipoprotein lipid attachment site  100 
 
 		 199 aa  413  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.160992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0084  hypothetical protein  44.83 
 
 		 202 aa  176  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1191  membrane lipoprotein lipid attachment site  39.61 
 
 		 207 aa  158  5e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00328821  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0126  putative lipoprotein  34.78 
 
 		 207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0086  putative lipoprotein  34.78 
 
 		 207 aa  133  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0180  conserved hypothetical lipoprotein  29.7 
 
 		 209 aa  91.3  8e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3947  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.74 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191679  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2792  hypothetical protein  27.5 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0824  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.98 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.525373  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004000  putative lipoprotein  27.08 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0189  hypothetical protein  26.09 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2514  putative lipoprotein  25.89 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01522  hypothetical protein  26.18 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3015  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.84 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0596  putative lipoprotein  26.77 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1484  putative lipoprotein  26.42 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.233925  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5474  putative lipoprotein  25.85 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3478  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.18 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0966746  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3403  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.18 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00726225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2914  hypothetical protein  25 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000421511  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1060  hypothetical protein  26.32 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3601  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.18 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3039  hypothetical protein  26.32 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000888459  normal  0.414715 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0935  hypothetical protein  26.32 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000406943  normal  0.0868767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0898  hypothetical protein  26.32 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000138757  normal  0.418189 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0884  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.18 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000370182  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2264  hypothetical protein  26.5 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0680426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0633  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.93 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3243  hypothetical protein  24.87 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126868  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1298  putative lipoprotein  25 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.41074  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0637  hypothetical protein  26.32 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0353203  normal  0.98697 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0964  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.21 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0219897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0836  membrane lipoprotein lipid attachment site  23.68 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0143317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1313  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.26 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.565237  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0606  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.14 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.467937 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1812  membrane lipoprotein lipid attachment site  29.19 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1891  membrane lipoprotein lipid attachment site  29.19 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2065  putative lipoprotein  29.19 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.274451  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0914  hypothetical protein  24.08 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.310752  normal  0.0133601 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0713  hypothetical protein  23.47 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1219  hypothetical protein  27.03 
 
 		 213 aa  48.1  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4205  hypothetical protein  22.3 
 
 		 208 aa  42  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2333  hypothetical protein  22.39 
 
 		 195 aa  42  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000127187  normal  0.606412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>