19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0701 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0701  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  348  2e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000726563  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1617  hypothetical protein  63.43 
 
 		 182 aa  229  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0533  hypothetical protein  49.43 
 
 		 183 aa  176  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3250  putative transcriptional regulator, GntR family  49.7 
 
 		 191 aa  164  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3684  hypothetical protein  45.14 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0007  DNA polymerase beta subunit  28.9 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2615  DNA polymerase beta subunit  25.45 
 
 		 195 aa  70.9  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506514  normal  0.0510048 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4942  regulatory protein ArsR  25.15 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0103  DNA polymerase beta subunit  32.03 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0359  DNA polymerase, beta-like region  29.84 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193538  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0842  DNA polymerase beta subunit  29.84 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0461071  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0814  DNA polymerase beta subunit  29.84 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3725  regulatory protein ArsR  24.12 
 
 		 197 aa  57.4  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5390  DNA polymerase beta domain protein region  27.59 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.536785  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1516  nucleotidyltransferase domain-containing protein  23.53 
 
 		 203 aa  54.3  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.387412  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2343  putative transcriptional regulator  25.47 
 
 		 210 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1731  putative transcriptional regulator  25.47 
 
 		 210 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0094  hypothetical protein  21.28 
 
 		 192 aa  51.2  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00270  hypothetical protein  22.02 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>