More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4534 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 		 451 aa  909    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.82 
 
 		 438 aa  574  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  63.36 
 
 		 435 aa  567  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.01 
 
 		 436 aa  560  1e-158  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  61.52 
 
 		 440 aa  556  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  59.91 
 
 		 434 aa  555  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  59.68 
 
 		 434 aa  553  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  60.4 
 
 		 456 aa  552  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  60.27 
 
 		 447 aa  549  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  60.19 
 
 		 438 aa  544  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  62.07 
 
 		 463 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  60.19 
 
 		 438 aa  543  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  60.65 
 
 		 434 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  60.19 
 
 		 434 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  58.33 
 
 		 441 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.85 
 
 		 437 aa  536  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  57.64 
 
 		 442 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.12 
 
 		 434 aa  538  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  60.53 
 
 		 452 aa  536  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  59.26 
 
 		 438 aa  536  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  59.72 
 
 		 434 aa  535  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  59.72 
 
 		 433 aa  531  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  58.43 
 
 		 439 aa  533  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.83 
 
 		 434 aa  530  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.96 
 
 		 438 aa  529  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.91 
 
 		 434 aa  526  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.63 
 
 		 436 aa  527  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  57.76 
 
 		 438 aa  527  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.29 
 
 		 434 aa  524  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.43 
 
 		 439 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.29 
 
 		 434 aa  524  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.54 
 
 		 437 aa  522  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  58.28 
 
 		 464 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  58.2 
 
 		 436 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2380  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  58.99 
 
 		 436 aa  514  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.97 
 
 		 436 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.31 
 
 		 438 aa  514  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  58.06 
 
 		 433 aa  508  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.97 
 
 		 438 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.51 
 
 		 433 aa  508  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.97 
 
 		 435 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.29 
 
 		 434 aa  503  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0785  nucleotide sugar dehydrogenase  54.77 
 
 		 449 aa  492  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180354  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0545  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.48 
 
 		 474 aa  476  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  53.18 
 
 		 441 aa  477  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0476  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.7 
 
 		 474 aa  477  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.10273  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4414  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.23 
 
 		 478 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.94 
 
 		 460 aa  458  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.03 
 
 		 440 aa  457  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1502  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.44 
 
 		 438 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.842125  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1348  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.15 
 
 		 460 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1714  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.53 
 
 		 436 aa  449  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0210  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.92 
 
 		 453 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  49.32 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  48.97 
 
 		 437 aa  433  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  48.97 
 
 		 437 aa  433  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  50.23 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  50.23 
 
 		 435 aa  428  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.23 
 
 		 436 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  48.18 
 
 		 438 aa  425  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.38 
 
 		 443 aa  426  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.6 
 
 		 440 aa  426  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.6 
 
 		 440 aa  426  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  50.9 
 
 		 473 aa  425  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  48.39 
 
 		 443 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.62 
 
 		 438 aa  425  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.53 
 
 		 447 aa  423  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  48.53 
 
 		 442 aa  422  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50 
 
 		 467 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1142  nucleotide sugar dehydrogenase  46.67 
 
 		 451 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3094  nucleotide sugar dehydrogenase  45.93 
 
 		 440 aa  416  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1513  nucleotide sugar dehydrogenase  46.45 
 
 		 437 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  46.14 
 
 		 440 aa  414  1e-114  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1466  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.52 
 
 		 445 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.434969  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  46.42 
 
 		 459 aa  415  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1257  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.42 
 
 		 445 aa  413  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1145  nucleotide sugar dehydrogenase  49.21 
 
 		 444 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91161  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  47.72 
 
 		 437 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  47.95 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  47.8 
 
 		 427 aa  411  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2042  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.65 
 
 		 445 aa  409  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.07 
 
 		 450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  46.12 
 
 		 440 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  45.75 
 
 		 466 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.17 
 
 		 437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.8 
 
 		 482 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0282  nucleotide sugar dehydrogenase  47.64 
 
 		 445 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.53 
 
 		 452 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.89 
 
 		 445 aa  403  1e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.85 
 
 		 457 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  47.1 
 
 		 482 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.85 
 
 		 444 aa  403  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  46.73 
 
 		 443 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  46.47 
 
 		 448 aa  402  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0726  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.18 
 
 		 457 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3200  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45 
 
 		 446 aa  402  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421836  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2287  nucleotide sugar dehydrogenase  45.82 
 
 		 450 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1143  sugar dehydrogenase  46.09 
 
 		 522 aa  399  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.17 
 
 		 473 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  45.49 
 
 		 470 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>