89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3254 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3254  PTS system sorbose subfamily IIB component  100 
 
 		 167 aa  350  7e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3428  PTS system sorbose subfamily IIB component  49.38 
 
 		 164 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000324846  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1272  phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIB  49.07 
 
 		 164 aa  170  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00454576  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1316  PTS system sorbose subfamily IIB component  46.01 
 
 		 164 aa  153  9e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.482248  normal  0.251904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4280  PTS system sorbose subfamily IIB component  40.61 
 
 		 164 aa  144  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3008  PTS system sorbose subfamily IIB component  42.33 
 
 		 161 aa  131  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.143042  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0348  PTS system, IIB component  32.48 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.270874  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2097  PTS system sorbose subfamily IIB component  29.53 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01775  hypothetical protein  27.88 
 
 		 323 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0856085  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2546  PTS system, mannose-specific IIAB component  27.88 
 
 		 323 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000579402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2083  PTS system, mannose-specific IIAB component  27.88 
 
 		 323 aa  68.2  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000444348  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01787  fused mannose-specific PTS enzymes: IIA component/IIB component  27.88 
 
 		 323 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0965607  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1371  PTS system, mannose-specific IIAB component  27.88 
 
 		 323 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000647863  normal  0.0229749 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2045  PTS system, mannose-specific IIAB component  27.88 
 
 		 323 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000183907  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1907  PTS system, mannose-specific IIAB component  27.88 
 
 		 323 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000431359  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1826  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  27.88 
 
 		 323 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000156617  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1302  PTS system, mannose-specific IIAB component  27.27 
 
 		 322 aa  67.4  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000497751  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1973  PTS system, mannose-specific IIAB component  27.27 
 
 		 322 aa  67.4  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00730165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1486  PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  27.27 
 
 		 322 aa  67.4  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2030  PTS system mannose-specific IIAB component  27.27 
 
 		 322 aa  67.4  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0638718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1969  PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  27.27 
 
 		 322 aa  67.4  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000485794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2464  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  26.06 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.134183  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0135  PTS system sorbose subfamily IIB component  28.92 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1651  PTS system mannose/fructose/sorbose family transporter subunit IIB  26.06 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.133869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2368  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  26.06 
 
 		 324 aa  67  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.15235  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2386  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIA subunit  27.88 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1983  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  25.45 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2813  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  24.42 
 
 		 323 aa  65.5  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.047129 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0379  phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIB  24.07 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1675  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  25.48 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2968  PTS system, IIB component  28.05 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3951  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  29.22 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0117  phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIB  27.85 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000562176  unclonable  1.30149e-28 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0951  PTS system sorbose subfamily IIB component  24.38 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0985047  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2021  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  24.24 
 
 		 313 aa  62  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1097  PTS system sorbose subfamily IIB component  28.67 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00631969  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3206  PTS system sorbose subfamily IIB component  26.83 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0372  mannose PTS system component IIAB  29.01 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000136714  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0804  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  25.45 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0818  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  25.45 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3025  PTS system sorbose subfamily IIB component  29.3 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4790  PTS system, IIB component  27.1 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.674783 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1950  PTS system, IIB component  29.19 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4950  PTS system transporter subunit IIB  27.1 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.315233  normal  0.320869 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4944  PTS system IIB component  27.1 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4891  PTS system transporter subunit IIB  27.1 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1926  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  24.24 
 
 		 322 aa  57.8  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0451  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  25.64 
 
 		 322 aa  57.8  0.00000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178007  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3475  PTS system sorbose subfamily IIB component  26.75 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255875  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3863  PTS system sorbose subfamily IIB component  24.36 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3699  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  28.95 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000890287  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2219  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  23.64 
 
 		 322 aa  57  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.854974  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1993  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  25.48 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.396142  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1768  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  28.39 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000481917  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1863  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  26.32 
 
 		 329 aa  55.5  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00596376  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0609  protein-N(pi)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase (phosphotransferase system mannose/fructose-specific IIA component)  22.22 
 
 		 323 aa  55.1  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000226836  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0464  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  25.77 
 
 		 331 aa  54.7  0.0000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000451703  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0361  PTS system, mannose-specific IIAB components  25.97 
 
 		 336 aa  54.7  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00370358  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1795  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  25.31 
 
 		 332 aa  53.5  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.172068  hitchhiker  1.3720900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1066  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  25.17 
 
 		 160 aa  51.6  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4479  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  24.84 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.705114 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0514  phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIB  22.49 
 
 		 164 aa  51.2  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000254817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0200  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  20.36 
 
 		 329 aa  50.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000259121  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1716  PTS system, IIB component  34.57 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3399  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  24.84 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00196922  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3430  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIB  24.34 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0992  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  23.38 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.529927  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02998  N-acetylgalactosamine-specific enzyme IIB component of PTS  24.34 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0572  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  24.34 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0940  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific phosphotransferase enzyme IIB component2  23.38 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3323  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIB  24.34 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3847  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  24 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9499 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3374  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIB  23.38 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.848899 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02949  hypothetical protein  24.34 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0567  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIB  24.34 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4050  PTS system sorbose subfamily transporter subunit IIB  23.12 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0918048 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4101  PTS system sorbose subfamily IIB component  23.12 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3978  PTS system sorbose subfamily IIB component  23.12 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3613  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIB  24.34 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903374  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3276  PTS system sorbose subfamily IIB component  23.12 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3996  PTS system sorbose subfamily IIB component  23.12 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4164  PTS system sorbose subfamily transporter subunit IIB  23.12 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.328304 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4447  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIB  23.68 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1500  PTS system sorbose subfamily IIB component  23.13 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.219995  hitchhiker  0.00883957 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0464  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  21.3 
 
 		 332 aa  43.9  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000027828  normal  0.826743 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2387  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIB  21.77 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3573  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIB  23.13 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.562122 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0970  PTS system sorbose subfamily IIB component  25.66 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1933  mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIB  22.42 
 
 		 160 aa  41.6  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.556817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>