25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3510 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3510  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  548  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0910  hypothetical protein  74.34 
 
 		 266 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3178  hypothetical protein  61.15 
 
 		 261 aa  327  9e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294574  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0786  hypothetical protein  58.4 
 
 		 261 aa  311  9e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.613295  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3180  hypothetical protein  58.4 
 
 		 261 aa  310  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0594296  normal  0.121226 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3846  hypothetical protein  58.4 
 
 		 261 aa  308  4e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0758  hypothetical protein  57.63 
 
 		 261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0270421  normal  0.286638 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0684  hypothetical protein  56.87 
 
 		 261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00404741  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3558  hypothetical protein  56.87 
 
 		 261 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00233545  normal  0.0372974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3749  hypothetical protein  56.87 
 
 		 261 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.511212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3626  hypothetical protein  56.11 
 
 		 261 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0790  hypothetical protein  56.11 
 
 		 261 aa  297  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2972  hypothetical protein  56.15 
 
 		 260 aa  297  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0841  hypothetical protein  51.2 
 
 		 259 aa  249  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0847  hypothetical protein  44.44 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000167513  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02113  hypothetical protein  43.33 
 
 		 256 aa  189  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003702  hypothetical protein  40.08 
 
 		 259 aa  182  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.354988  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2632  hypothetical protein  41.83 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.535591  normal  0.96162 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0854  hypothetical protein  44.71 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49781  predicted protein  28.08 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47724  predicted protein  31.71 
 
 		 646 aa  47  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642125  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  27.27 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  26.5 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01140  hypothetical protein  25.38 
 
 		 439 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  30.88 
 
 		 250 aa  43.5  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>