36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0019 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0019  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  301  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110253 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0016  hypothetical protein  75 
 
 		 155 aa  234  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226962 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0012  hypothetical protein  68.75 
 
 		 145 aa  210  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0012  hypothetical protein  68.06 
 
 		 145 aa  209  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0016  hypothetical protein  67.81 
 
 		 148 aa  207  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000149396 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0016  hypothetical protein  67.12 
 
 		 148 aa  206  7e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0012  hypothetical protein  67.12 
 
 		 148 aa  206  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0017  hypothetical protein  66.44 
 
 		 148 aa  204  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0020  MOSC domain-containing protein  67.36 
 
 		 145 aa  204  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.606276  hitchhiker  0.0000000172861 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0010  hypothetical protein  63.7 
 
 		 150 aa  199  8e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.276585  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0018  hypothetical protein  66.9 
 
 		 145 aa  196  7.999999999999999e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0014  hypothetical protein  63.89 
 
 		 146 aa  192  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124057  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0011  hypothetical protein  64.14 
 
 		 145 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0010  hypothetical protein  61.27 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0012  MOSC domain-containing protein  57.86 
 
 		 149 aa  173  7e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000770125  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2603  MOSC domain-containing protein  43.54 
 
 		 151 aa  117  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1966  hypothetical protein  40.13 
 
 		 156 aa  84.7  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0292017  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  29.93 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  28.97 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  33.1 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  29.37 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  32.87 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  32.8 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  33.09 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  32.17 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  31.37 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  27.27 
 
 		 153 aa  52  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  31.47 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  27.89 
 
 		 177 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  28.28 
 
 		 175 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  27.89 
 
 		 174 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0358  MOSC  33.02 
 
 		 155 aa  47.4  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2061  hypothetical protein  29.06 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000026195  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  28.08 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5172  hypothetical protein  26.47 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58850  hypothetical protein  25 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.111042 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>