24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2608 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2608  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  713    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242922  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2610  hypothetical protein  43.94 
 
 		 295 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3107  hypothetical protein  39.59 
 
 		 347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1127  Terpene synthase metal-binding domain-containing protein  26.65 
 
 		 769 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0393162 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0622  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  30.13 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0581453 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0493  Terpene synthase, metal-binding protein  28.62 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3509  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  29.91 
 
 		 326 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0075  putative terpene cyclase  26.65 
 
 		 745 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4730  Terpene synthase metal-binding domain protein  30.9 
 
 		 321 aa  89.7  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0913781  decreased coverage  0.0000445956 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4231  Terpene synthase, metal-binding  29.37 
 
 		 751 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1257  Terpene synthase metal-binding domain protein  28.36 
 
 		 756 aa  86.3  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0977  Terpene synthase metal-binding domain protein  28.36 
 
 		 751 aa  82.8  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2988  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  24.24 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5559  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  28.73 
 
 		 750 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6200  Terpene synthase metal-binding domain protein  30.22 
 
 		 755 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2987  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  26.06 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4100  Terpene synthase metal-binding domain protein  25.78 
 
 		 325 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  hitchhiker  0.00192352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3949  Terpene synthase metal-binding domain protein  24.85 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.598954  normal  0.405526 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1797  Terpene synthase metal-binding domain protein  22.81 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1982  Terpene synthase, metal-binding  23.41 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150078  normal  0.785629 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2648  hypothetical protein  26.06 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0947  lyase  31.97 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000129184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6866  hypothetical protein  29.1 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2716  hypothetical protein  23.2 
 
 		 324 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>