66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0517 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0517  primase/topoisomerase like protein  100 
 
 
371 aa  734  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0087  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  39.33 
 
 
425 aa  147  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2965  primase/topoisomerase like protein  43.39 
 
 
192 aa  140  2e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  1.4203e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0668  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  34.64 
 
 
419 aa  129  1e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0545  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  34.29 
 
 
417 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0448  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  33.15 
 
 
417 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0217552  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3471  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  33.15 
 
 
419 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4937  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  31.84 
 
 
410 aa  124  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3491  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  33.52 
 
 
423 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4625  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  31.84 
 
 
410 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4989  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  31.84 
 
 
410 aa  124  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3666  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  31.84 
 
 
410 aa  124  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04266  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  31.84 
 
 
410 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04231  hypothetical protein  31.84 
 
 
410 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3620  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  32.96 
 
 
423 aa  124  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0824  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  32.96 
 
 
423 aa  124  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4990  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  31.28 
 
 
410 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4992  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  31.28 
 
 
410 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4904  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  31.28 
 
 
410 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4831  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  31.28 
 
 
410 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4938  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  31.28 
 
 
410 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4939  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  31.28 
 
 
410 aa  122  1e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.524439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5904  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  31.28 
 
 
410 aa  122  1e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.793869  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3608  transcriptional regulator, XRE family  31.28 
 
 
410 aa  122  1e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0549  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  31.46 
 
 
410 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3590  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  31.28 
 
 
418 aa  119  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.124928  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1510  primase/topoisomerase like protein  40.78 
 
 
176 aa  118  1e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  4.57105e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2527  primase-like protein  39.58 
 
 
182 aa  118  2e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2841  primase-like protein  39.58 
 
 
182 aa  118  2e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3133  cytidyltransferase-related domain protein  36.36 
 
 
344 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0036  primase/topoisomerase like protein  37.16 
 
 
187 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.278687  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0073  primase/topoisomerase like protein  33.51 
 
 
205 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  5.89128e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0035  primase/topoisomerase like protein  32.8 
 
 
185 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0212  ribonuclease M5  31.77 
 
 
188 aa  102  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5271  primase-related protein  32.8 
 
 
185 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0035  primase/topoisomerase like protein  32.26 
 
 
185 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0045  primase-related protein  32.8 
 
 
185 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0045  primase-related protein  32.8 
 
 
185 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0049  primase-related protein  32.8 
 
 
185 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0036  ribonuclease M5  32.8 
 
 
185 aa  100  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  7.47887e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0036  ribonuclease M5  32.8 
 
 
185 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0039  primase-related protein  32.8 
 
 
185 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0820381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0038  primase-related protein  32.8 
 
 
185 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0038  primase-related protein  32.8 
 
 
185 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0130  primase-related protein  35.52 
 
 
181 aa  99  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.503861  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0513  hypothetical protein  34.07 
 
 
178 aa  96.7  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.029642  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0526  hypothetical protein  34.07 
 
 
178 aa  96.7  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0178284  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0034  primase/topoisomerase like protein  33.69 
 
 
182 aa  96.3  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1773  ribonuclease M5  30.89 
 
 
186 aa  84.3  3e-15  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1781  primase-related protein  31.94 
 
 
186 aa  84.7  3e-15  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0130  primase/topoisomerase like protein  23.94 
 
 
191 aa  84  4e-15  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.504524  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0207  ribonuclease M5  30.43 
 
 
187 aa  83.2  6e-15  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.77928e-06  normal  0.0149756 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0717  hypothetical protein  30 
 
 
186 aa  79  1e-13  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.740448  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1614  ribonuclease M5  28.34 
 
 
189 aa  75.5  1e-12  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0896  transcriptional regulator  30.22 
 
 
397 aa  67.4  3e-10  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0772254  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0184  primase homolog  32.02 
 
 
179 aa  66.2  9e-10  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl004  nucleotidyltransferase, primase  32.97 
 
 
175 aa  65.5  1e-09  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2249  transcriptional regulator  26.97 
 
 
379 aa  63.5  6e-09  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1517  NMN adenylytransferase and ribosylnicotinamide kinase, NadR ortholog  27.16 
 
 
380 aa  57.8  3e-07  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0003  primase-related protein  34.44 
 
 
180 aa  56.6  7e-07  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.458899  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0466  transcriptional regulator  25.13 
 
 
350 aa  54.7  2e-06  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00195709  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1550  ribonuclease M5  25.14 
 
 
184 aa  54.7  3e-06  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1095  cytidyltransferase-related domain protein  27.43 
 
 
336 aa  54.3  3e-06  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.50674e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2778  cytidyltransferase-like protein  23.16 
 
 
340 aa  50.4  5e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32270  cytidyltransferase-related enzyme  23.44 
 
 
395 aa  48.9  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.399426  normal  0.498832 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5743  cytidyltransferase-related domain protein  24.57 
 
 
341 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000167926  normal  0.526346 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>