34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl004 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl004  nucleotidyltransferase, primase  100 
 
 
175 aa  338  2e-92  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0003  primase-related protein  62.21 
 
 
180 aa  221  4e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.458899  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0184  primase homolog  39.66 
 
 
179 aa  105  3e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0035  primase/topoisomerase like protein  38.1 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0036  primase/topoisomerase like protein  39.71 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.278687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0045  primase-related protein  38.1 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0038  primase-related protein  38.1 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0045  primase-related protein  38.1 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5271  primase-related protein  38.1 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0049  primase-related protein  38.1 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0038  primase-related protein  38.1 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0036  ribonuclease M5  38.1 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000747887  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0036  ribonuclease M5  38.1 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0039  primase-related protein  38.1 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0820381  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0035  primase/topoisomerase like protein  37.3 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0717  hypothetical protein  29.28 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.740448  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0207  ribonuclease M5  36.04 
 
 
187 aa  72  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000177928  normal  0.0149756 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1781  primase-related protein  35.34 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0034  primase/topoisomerase like protein  37.96 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0130  primase-related protein  38.68 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.503861  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0513  hypothetical protein  36.79 
 
 
178 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.029642  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0526  hypothetical protein  36.79 
 
 
178 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0178284  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1773  ribonuclease M5  26.98 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0517  primase/topoisomerase like protein  32.97 
 
 
371 aa  65.5  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0073  primase/topoisomerase like protein  35.09 
 
 
205 aa  63.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000589128  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0212  ribonuclease M5  35.71 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2527  primase-like protein  31.49 
 
 
182 aa  63.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2841  primase-like protein  32.1 
 
 
182 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1614  ribonuclease M5  32.17 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1510  primase/topoisomerase like protein  29.35 
 
 
176 aa  56.6  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000457105  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1550  ribonuclease M5  33.65 
 
 
184 aa  54.3  0.0000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2965  primase/topoisomerase like protein  31.21 
 
 
192 aa  53.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000014203  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0130  primase/topoisomerase like protein  23.58 
 
 
191 aa  46.6  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.504524  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3082  TOPRIM domain protein  33.87 
 
 
119 aa  42  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>