37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1550 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1550  ribonuclease M5  100 
 
 
184 aa  364  1e-100  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0207  ribonuclease M5  42.37 
 
 
187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000177928  normal  0.0149756 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1781  primase-related protein  41.01 
 
 
186 aa  135  4e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1614  ribonuclease M5  41.11 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0717  hypothetical protein  41.01 
 
 
186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.740448  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1773  ribonuclease M5  42.46 
 
 
186 aa  127  9.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0035  primase/topoisomerase like protein  39.33 
 
 
185 aa  125  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0045  primase-related protein  39.33 
 
 
185 aa  123  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0212  ribonuclease M5  40.22 
 
 
188 aa  123  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0049  primase-related protein  39.33 
 
 
185 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0038  primase-related protein  39.33 
 
 
185 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0036  ribonuclease M5  39.33 
 
 
185 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000747887  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0036  ribonuclease M5  39.33 
 
 
185 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0038  primase-related protein  39.33 
 
 
185 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0035  primase/topoisomerase like protein  39.89 
 
 
185 aa  123  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0045  primase-related protein  39.33 
 
 
185 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0039  primase-related protein  39.33 
 
 
185 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0820381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5271  primase-related protein  39.33 
 
 
185 aa  122  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0034  primase/topoisomerase like protein  36.36 
 
 
182 aa  117  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0513  hypothetical protein  37.36 
 
 
178 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.029642  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0526  hypothetical protein  37.36 
 
 
178 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0178284  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0130  primase-related protein  36.05 
 
 
181 aa  112  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.503861  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0036  primase/topoisomerase like protein  37.08 
 
 
187 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.278687  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2527  primase-like protein  33.33 
 
 
182 aa  101  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2841  primase-like protein  33.33 
 
 
182 aa  100  9e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0073  primase/topoisomerase like protein  33.7 
 
 
205 aa  94.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000589128  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2965  primase/topoisomerase like protein  32.2 
 
 
192 aa  92  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000014203  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1510  primase/topoisomerase like protein  32.78 
 
 
176 aa  91.7  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000457105  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0130  primase/topoisomerase like protein  27.42 
 
 
191 aa  77.8  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.504524  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0184  primase homolog  29.89 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0003  primase-related protein  25.14 
 
 
180 aa  62.4  0.000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.458899  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0517  primase/topoisomerase like protein  25.14 
 
 
371 aa  59.7  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl004  nucleotidyltransferase, primase  26.37 
 
 
175 aa  59.3  0.00000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26186  predicted protein  25.45 
 
 
215 aa  53.9  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.347334  normal  0.492829 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2949  TOPRIM domain protein  32.5 
 
 
115 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0852  TOPRIM domain-containing protein  30.38 
 
 
128 aa  41.6  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000918877  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0836  TOPRIM domain-containing protein  30.38 
 
 
129 aa  41.6  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00405243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>