35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0207 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0207  ribonuclease M5  100 
 
 
187 aa  378  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000177928  normal  0.0149756 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1614  ribonuclease M5  48.42 
 
 
189 aa  148  6e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1773  ribonuclease M5  46.63 
 
 
186 aa  147  8e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1781  primase-related protein  44.07 
 
 
186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0212  ribonuclease M5  44.32 
 
 
188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0035  primase/topoisomerase like protein  42.61 
 
 
185 aa  140  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0717  hypothetical protein  42.31 
 
 
186 aa  139  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.740448  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0045  primase-related protein  41.48 
 
 
185 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0049  primase-related protein  41.48 
 
 
185 aa  136  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0038  primase-related protein  41.48 
 
 
185 aa  136  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0036  ribonuclease M5  41.48 
 
 
185 aa  136  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000747887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0045  primase-related protein  41.48 
 
 
185 aa  136  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0036  ribonuclease M5  41.48 
 
 
185 aa  136  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0039  primase-related protein  41.48 
 
 
185 aa  136  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0820381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0038  primase-related protein  41.48 
 
 
185 aa  136  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5271  primase-related protein  40.91 
 
 
185 aa  134  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0035  primase/topoisomerase like protein  40.34 
 
 
185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1550  ribonuclease M5  41.85 
 
 
184 aa  128  5.0000000000000004e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0513  hypothetical protein  41.76 
 
 
178 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.029642  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0526  hypothetical protein  41.76 
 
 
178 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0178284  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0034  primase/topoisomerase like protein  39.77 
 
 
182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2841  primase-like protein  39.2 
 
 
182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2527  primase-like protein  38.64 
 
 
182 aa  118  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0036  primase/topoisomerase like protein  40.34 
 
 
187 aa  117  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.278687  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0130  primase-related protein  39.44 
 
 
181 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.503861  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2965  primase/topoisomerase like protein  38.51 
 
 
192 aa  107  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000014203  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1510  primase/topoisomerase like protein  39.44 
 
 
176 aa  103  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000457105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0073  primase/topoisomerase like protein  31.41 
 
 
205 aa  94.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000589128  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0184  primase homolog  34.27 
 
 
179 aa  92.8  3e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0130  primase/topoisomerase like protein  34.02 
 
 
191 aa  92  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.504524  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0517  primase/topoisomerase like protein  30.43 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl004  nucleotidyltransferase, primase  36.04 
 
 
175 aa  72  0.000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0003  primase-related protein  26.55 
 
 
180 aa  67  0.0000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.458899  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26186  predicted protein  27.44 
 
 
215 aa  43.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.347334  normal  0.492829 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2931  TOPRIM domain protein  27.78 
 
 
116 aa  41.6  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000218405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>