33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0034 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0034  primase/topoisomerase like protein  100 
 
 
182 aa  364  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0036  primase/topoisomerase like protein  75.69 
 
 
187 aa  291  4e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.278687  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0035  primase/topoisomerase like protein  63.48 
 
 
185 aa  254  5e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0045  primase-related protein  61.8 
 
 
185 aa  246  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5271  primase-related protein  61.8 
 
 
185 aa  245  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0038  primase-related protein  61.8 
 
 
185 aa  245  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0049  primase-related protein  61.8 
 
 
185 aa  245  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0045  primase-related protein  61.8 
 
 
185 aa  245  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0038  primase-related protein  61.8 
 
 
185 aa  245  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0036  ribonuclease M5  61.8 
 
 
185 aa  245  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000747887  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0036  ribonuclease M5  61.8 
 
 
185 aa  245  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0039  primase-related protein  61.8 
 
 
185 aa  245  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0820381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0035  primase/topoisomerase like protein  61.24 
 
 
185 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0130  primase-related protein  51.46 
 
 
181 aa  166  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.503861  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0212  ribonuclease M5  45.25 
 
 
188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0513  hypothetical protein  53.12 
 
 
178 aa  162  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.029642  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0526  hypothetical protein  53.12 
 
 
178 aa  162  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0178284  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1773  ribonuclease M5  47.73 
 
 
186 aa  159  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0717  hypothetical protein  47.59 
 
 
186 aa  158  5e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.740448  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1614  ribonuclease M5  51.48 
 
 
189 aa  157  7e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1781  primase-related protein  46.43 
 
 
186 aa  154  9e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2527  primase-like protein  46.86 
 
 
182 aa  152  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2841  primase-like protein  47.43 
 
 
182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1510  primase/topoisomerase like protein  45.09 
 
 
176 aa  144  8.000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000457105  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0207  ribonuclease M5  39.77 
 
 
187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000177928  normal  0.0149756 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2965  primase/topoisomerase like protein  40.68 
 
 
192 aa  119  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000014203  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0073  primase/topoisomerase like protein  36.79 
 
 
205 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000589128  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1550  ribonuclease M5  36.36 
 
 
184 aa  111  5e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0130  primase/topoisomerase like protein  37.08 
 
 
191 aa  108  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.504524  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0517  primase/topoisomerase like protein  33.69 
 
 
371 aa  96.3  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0184  primase homolog  33.74 
 
 
179 aa  93.2  2e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0003  primase-related protein  38.89 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.458899  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl004  nucleotidyltransferase, primase  37.96 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>