46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1510 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1510  primase/topoisomerase like protein  100 
 
 		 176 aa  351  2.9999999999999997e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000457105  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2965  primase/topoisomerase like protein  59.09 
 
 		 192 aa  192  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000014203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2527  primase-like protein  51.69 
 
 		 182 aa  175  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2841  primase-like protein  51.12 
 
 		 182 aa  174  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0036  primase/topoisomerase like protein  46.89 
 
 		 187 aa  151  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.278687  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0073  primase/topoisomerase like protein  42.47 
 
 		 205 aa  144  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000589128  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0034  primase/topoisomerase like protein  45.09 
 
 		 182 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0212  ribonuclease M5  43.26 
 
 		 188 aa  143  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0035  primase/topoisomerase like protein  42.2 
 
 		 185 aa  141  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0045  primase-related protein  42.77 
 
 		 185 aa  140  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0035  primase/topoisomerase like protein  42.77 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0038  primase-related protein  42.77 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0039  primase-related protein  42.77 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0820381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0045  primase-related protein  42.77 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5271  primase-related protein  42.77 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0049  primase-related protein  42.77 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0038  primase-related protein  42.77 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0036  ribonuclease M5  42.77 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000747887  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0036  ribonuclease M5  42.77 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0526  hypothetical protein  45.14 
 
 		 178 aa  138  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0178284  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0513  hypothetical protein  45.14 
 
 		 178 aa  138  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.029642  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0130  primase-related protein  44.51 
 
 		 181 aa  135  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.503861  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1773  ribonuclease M5  41.01 
 
 		 186 aa  124  9e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0130  primase/topoisomerase like protein  36.81 
 
 		 191 aa  121  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.504524  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0717  hypothetical protein  39.11 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.740448  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1781  primase-related protein  38.55 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0517  primase/topoisomerase like protein  40.78 
 
 		 371 aa  118  3.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1614  ribonuclease M5  40 
 
 		 189 aa  114  6.9999999999999995e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0207  ribonuclease M5  39.44 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000177928  normal  0.0149756 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1550  ribonuclease M5  32.78 
 
 		 184 aa  87  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0184  primase homolog  27.84 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0003  primase-related protein  33.15 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.458899  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl004  nucleotidyltransferase, primase  29.35 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3082  TOPRIM domain protein  30.09 
 
 		 119 aa  48.5  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26186  predicted protein  27.89 
 
 		 215 aa  47  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.347334  normal  0.492829 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4812  TOPRIM domain-containing protein  34.12 
 
 		 114 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000913447  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3585  TOPRIM domain-containing protein  35.29 
 
 		 114 aa  45.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000963608  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5226  TOPRIM domain-containing protein  32.94 
 
 		 114 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4858  TOPRIM domain-containing protein  32.94 
 
 		 114 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0016713  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5133  Toprim domain protein  32.94 
 
 		 114 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0107  Toprim domain protein  32.94 
 
 		 114 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000016673  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4715  DNA primase  32.94 
 
 		 114 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000708612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5096  Toprim domain protein  32.94 
 
 		 114 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5132  Toprim domain protein  32.94 
 
 		 114 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000167755  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4699  DNA primase  32.94 
 
 		 114 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00338236  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5128  TOPRIM domain-containing protein  32.94 
 
 		 114 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>