More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2275 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2275  ATPase  100 
 
 		 337 aa  673    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2792  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  82.79 
 
 		 336 aa  560  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258088 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3056  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  81.9 
 
 		 336 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0112658 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3229  MoxR family protein  82.35 
 
 		 342 aa  541  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1556  moxR protein  75.23 
 
 		 335 aa  504  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2179  ATPase  77.44 
 
 		 340 aa  506  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1504  moxR protein  75.23 
 
 		 335 aa  504  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.408209  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1609  ATPase  74.92 
 
 		 335 aa  503  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1007  AAA family ATPase  67.9 
 
 		 343 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.664695  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0916  ATPase  71.79 
 
 		 334 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0786  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  68.75 
 
 		 333 aa  454  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112127 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2844  ATPase  69.25 
 
 		 333 aa  457  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2626  ATPase  70.22 
 
 		 337 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5171  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  67.07 
 
 		 336 aa  450  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311831  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3251  ATPase  69.91 
 
 		 346 aa  448  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2271  putative MoxR family protein  69.59 
 
 		 332 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1376  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  68.03 
 
 		 334 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.875215  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1192  ATPase  68.34 
 
 		 332 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1456  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  65.84 
 
 		 336 aa  436  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  0.294697 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1295  ATPase  67.71 
 
 		 334 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.962935  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4480  ATPase  65.85 
 
 		 336 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.290117  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1459  ATPase  65.83 
 
 		 336 aa  432  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  0.0369744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1736  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  65.83 
 
 		 336 aa  432  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0658349 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2948  ATPase  69.74 
 
 		 333 aa  434  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2234  ATPase  67.3 
 
 		 349 aa  427  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0369  ATPase  62.99 
 
 		 336 aa  424  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.536923  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3013  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  65.48 
 
 		 350 aa  411  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0925287  normal  0.302039 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  61.52 
 
 		 332 aa  409  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3635  ATPase  64.63 
 
 		 334 aa  411  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2906  hypothetical protein  60.43 
 
 		 335 aa  394  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106091  normal  0.402062 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0683  AAA_3 ATPase  60.98 
 
 		 335 aa  391  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0203  ATPase  62.61 
 
 		 338 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.526307 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3901  ATPase  63.08 
 
 		 333 aa  391  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1024  putative MoxR family protein  61.7 
 
 		 338 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2685  ATPase  61.7 
 
 		 338 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  65 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2767  ATPase  61.81 
 
 		 335 aa  345  7e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2500  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.79 
 
 		 308 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0488  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.99 
 
 		 320 aa  326  3e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.26 
 
 		 320 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.485502 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1950  ATPase  49.51 
 
 		 317 aa  318  6e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.19 
 
 		 327 aa  318  7e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.9 
 
 		 327 aa  317  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00950  methanol dehydrogenase regulator-like protein  48.26 
 
 		 317 aa  316  3e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  51.27 
 
 		 356 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3175  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.62 
 
 		 379 aa  312  4.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0190  methanol dehydrogenase regulator  48.5 
 
 		 321 aa  309  5e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.17889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.65 
 
 		 351 aa  308  9e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4422  ATPase  50 
 
 		 338 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.47 
 
 		 334 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1689  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.33 
 
 		 338 aa  301  7.000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4268  ATPase associated with various cellular activities, AAA-3  50 
 
 		 343 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1801  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.35 
 
 		 349 aa  300  3e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2094  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.27 
 
 		 356 aa  298  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.640713  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4423  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 		 341 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.886882  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.17 
 
 		 341 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.861235  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3263  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.94 
 
 		 341 aa  288  8e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.0121123 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0207  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.57 
 
 		 333 aa  287  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.26 
 
 		 345 aa  283  4.0000000000000003e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1888  ATPase  46.77 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.277676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3818  ATPase  46.45 
 
 		 334 aa  280  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0254  ATPase  45.02 
 
 		 329 aa  280  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.211212  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.85 
 
 		 334 aa  278  1e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  47.08 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.43 
 
 		 325 aa  276  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1738  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.91 
 
 		 333 aa  276  4e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3671  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.6 
 
 		 334 aa  275  7e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1088  ATPase  46.25 
 
 		 318 aa  275  9e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0233  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.69 
 
 		 325 aa  272  5.000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0804  ATPase  44.74 
 
 		 324 aa  271  8.000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1932  moxR-like ATPase  45.25 
 
 		 324 aa  269  4e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.98 
 
 		 313 aa  263  4e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  39.45 
 
 		 329 aa  251  9.000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  43.05 
 
 		 328 aa  250  3e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2870  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.22 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.648175  normal  0.0812651 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2649  moxR-like ATPase  39.61 
 
 		 339 aa  245  6.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.342238  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1787  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.34 
 
 		 327 aa  245  9e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000466383  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  41.69 
 
 		 332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.62 
 
 		 310 aa  243  3e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.86 
 
 		 329 aa  242  7.999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  41.32 
 
 		 330 aa  241  9e-63  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.43 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2447  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.01 
 
 		 331 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38370  hypothetical protein  44.94 
 
 		 328 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  44.58 
 
 		 325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4025  ATPase  43.41 
 
 		 346 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1835  ATPase  43.93 
 
 		 315 aa  239  5.999999999999999e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  39.94 
 
 		 340 aa  239  6.999999999999999e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0252  hypothetical protein  41.56 
 
 		 316 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.486199  normal  0.225181 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4333  moxR protein, putative  43.73 
 
 		 349 aa  238  8e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1170  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.73 
 
 		 341 aa  238  8e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.09 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2293  ATPase associated with various cellular activities  41.88 
 
 		 316 aa  236  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4443  ATPase  45.66 
 
 		 333 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.259464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  43.37 
 
 		 353 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3389  ATPase  42.81 
 
 		 333 aa  235  6e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428548 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3413  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.28 
 
 		 324 aa  235  7e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  45.28 
 
 		 326 aa  235  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.42 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1713  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  41.75 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0920978  hitchhiker  0.00500993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>