More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35310 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_35310  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
197 aa  381  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.238269  normal  0.306388 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  81.18 
 
 
191 aa  298  3e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3147  orotate phosphoribosyltransferase  86.41 
 
 
192 aa  291  6e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2425  orotate phosphoribosyltransferase  89.67 
 
 
191 aa  280  1e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.205434 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3646  orotate phosphoribosyltransferase  67.38 
 
 
188 aa  236  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01980  orotate phosphoribosyltransferase  63.45 
 
 
195 aa  229  1e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0503  orotate phosphoribosyltransferase  64.48 
 
 
187 aa  213  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5160  orotate phosphoribosyltransferase  64.44 
 
 
192 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0512  orotate phosphoribosyltransferase  60.34 
 
 
194 aa  211  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4631  orotate phosphoribosyltransferase  61.88 
 
 
177 aa  210  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10387  orotate phosphoribosyltransferase  61.05 
 
 
179 aa  209  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.32666e-16  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0652  orotate phosphoribosyltransferase  58.47 
 
 
194 aa  207  8e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0394  Orotate phosphoribosyltransferase  66.12 
 
 
178 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4186  orotate phosphoribosyltransferase  58.97 
 
 
191 aa  205  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0181  orotate phosphoribosyltransferase  63.78 
 
 
178 aa  205  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25780  orotate phosphoribosyltransferase  62.43 
 
 
199 aa  203  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0210  orotate phosphoribosyltransferase  61.08 
 
 
178 aa  201  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05620  orotate phosphoribosyltransferase  66.85 
 
 
185 aa  201  8e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0920693  normal  0.821582 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0130  orotate phosphoribosyltransferase  62.78 
 
 
179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000251206 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0125  orotate phosphoribosyltransferase  61.11 
 
 
179 aa  195  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4069  orotate phosphoribosyltransferase  65.7 
 
 
191 aa  193  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269841  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38490  orotate phosphoribosyltransferase  65.29 
 
 
189 aa  187  8e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6936  orotate phosphoribosyltransferase  62.79 
 
 
184 aa  186  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.824462  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3008  orotate phosphoribosyltransferase  59.02 
 
 
177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8390  orotate phosphoribosyltransferase  62.03 
 
 
191 aa  180  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.353067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6419  orotate phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 
174 aa  178  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4786  orotate phosphoribosyltransferase  59.67 
 
 
199 aa  175  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288171  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2123  orotate phosphoribosyltransferase  55.56 
 
 
196 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  43.96 
 
 
198 aa  138  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1325  orotate phosphoribosyltransferase  43.18 
 
 
185 aa  138  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1938  orotate phosphoribosyltransferase  43.17 
 
 
182 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1154  orotate phosphoribosyltransferase  43.18 
 
 
182 aa  135  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2703  orotate phosphoribosyltransferase  41.53 
 
 
183 aa  135  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0442  orotate phosphoribosyltransferase  43.56 
 
 
184 aa  134  6.0000000000000005e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.297345  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2358  orotate phosphoribosyltransferase  40.66 
 
 
206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140374  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2462  orotate phosphoribosyltransferase  40.11 
 
 
208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0847  orotate phosphoribosyltransferase  38.8 
 
 
187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1121  orotate phosphoribosyltransferase  36.87 
 
 
203 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  38.8 
 
 
187 aa  128  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2069  orotate phosphoribosyltransferase  39.34 
 
 
182 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372282  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  38.25 
 
 
187 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1637  orotate phosphoribosyltransferase  38.8 
 
 
182 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3708  orotate phosphoribosyltransferase  47.95 
 
 
190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3634  orotate phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 
189 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.274017  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4858  orotate phosphoribosyltransferase  38.8 
 
 
187 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3568  orotate phosphoribosyltransferase  47.67 
 
 
189 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0180203  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1176  orotate phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 
195 aa  123  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7360  orotate phosphoribosyltransferase  39.33 
 
 
185 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1305  orotate phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
187 aa  121  6e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0451  orotate phosphoribosyltransferase  36.76 
 
 
213 aa  120  9e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3689  orotate phosphoribosyltransferase  41.97 
 
 
212 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.477212  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0231  orotate phosphoribosyltransferase  39.68 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03021  orotate phosphoribosyltransferase  41.21 
 
 
194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.0000452779  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3177  orotate phosphoribosyltransferase  39.89 
 
 
184 aa  119  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  38.42 
 
 
186 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3572  orotate phosphoribosyltransferase  39.56 
 
 
201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2541  orotate phosphoribosyltransferase  39.56 
 
 
201 aa  117  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.536465  normal  0.0846935 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1651  orotate phosphoribosyltransferase  38.92 
 
 
208 aa  117  7.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.394829  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1892  orotate phosphoribosyltransferase  40.98 
 
 
182 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2328  orotate phosphoribosyltransferase  40.98 
 
 
182 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02981  orotate phosphoribosyltransferase  40.11 
 
 
186 aa  114  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1456  orotate phosphoribosyltransferase  37.36 
 
 
183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351938  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02991  orotate phosphoribosyltransferase  39.55 
 
 
186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.734545  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5105  orotate phosphoribosyltransferase  43.64 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.077972  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1455  orotate phosphoribosyltransferase  40.66 
 
 
185 aa  111  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2592  orotate phosphoribosyltransferase  41.57 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03081  orotate phosphoribosyltransferase  37.35 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.691934  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0460  orotate phosphoribosyltransferase  39.01 
 
 
204 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.249088  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1469  orotate phosphoribosyltransferase  37.02 
 
 
186 aa  109  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.980339 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2463  orotate phosphoribosyltransferase  37.64 
 
 
188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081584 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  35.23 
 
 
186 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0277  orotate phosphoribosyltransferase  36.16 
 
 
186 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03551  orotate phosphoribosyltransferase  36.67 
 
 
193 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.750537  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0153  orotate phosphoribosyltransferase  36.72 
 
 
187 aa  105  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3103  orotate phosphoribosyltransferase  33.7 
 
 
187 aa  105  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0260  orotate phosphoribosyltransferase  39.56 
 
 
194 aa  104  7e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1641  orotate phosphoribosyltransferase  36.11 
 
 
215 aa  104  9e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2766  orotate phosphoribosyltransferase  39.38 
 
 
191 aa  101  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0096  orotate phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 
193 aa  99  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5893  phosphoribosyltransferase  42.25 
 
 
193 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2110  orotate phosphoribosyltransferase  40.8 
 
 
189 aa  97.1  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.254535 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  35.12 
 
 
179 aa  95.9  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  35.06 
 
 
185 aa  95.1  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  34.41 
 
 
185 aa  94.7  9e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  33.87 
 
 
185 aa  94  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1170  orotate phosphoribosyltransferase  34.1 
 
 
166 aa  94.4  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24961  orotate phosphoribosyltransferase  38.98 
 
 
196 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0801  orotate phosphoribosyltransferase  33.87 
 
 
185 aa  93.6  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 
187 aa  92.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  35.2 
 
 
182 aa  88.6  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  33.53 
 
 
191 aa  85.5  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1209  hypothetical protein  40.46 
 
 
209 aa  85.1  6e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  35.84 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  32.95 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1944  orotate phosphoribosyltransferase  37.57 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5503  orotate phosphoribosyltransferase  37.35 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5123  orotate phosphoribosyltransferase  37.35 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5212  orotate phosphoribosyltransferase  37.35 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365992  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  34.46 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  34.64 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>