29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3180 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3180  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  535  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0594296  normal  0.121226 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0786  hypothetical protein  99.23 
 
 		 261 aa  533  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.613295  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0758  hypothetical protein  98.47 
 
 		 261 aa  527  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0270421  normal  0.286638 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3846  hypothetical protein  85.82 
 
 		 261 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3558  hypothetical protein  79.69 
 
 		 261 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00233545  normal  0.0372974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3749  hypothetical protein  80.08 
 
 		 261 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.511212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3626  hypothetical protein  79.31 
 
 		 261 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0684  hypothetical protein  78.93 
 
 		 261 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00404741  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0790  hypothetical protein  76.63 
 
 		 261 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3510  hypothetical protein  58.4 
 
 		 267 aa  310  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0910  hypothetical protein  57.98 
 
 		 266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2972  hypothetical protein  58.37 
 
 		 260 aa  298  7e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3178  hypothetical protein  58.43 
 
 		 261 aa  296  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294574  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0841  hypothetical protein  57.6 
 
 		 259 aa  276  3e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0847  hypothetical protein  46.83 
 
 		 259 aa  207  9e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000167513  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003702  hypothetical protein  44.66 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.354988  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02113  hypothetical protein  50.49 
 
 		 256 aa  201  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2632  hypothetical protein  39.3 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.535591  normal  0.96162 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0854  hypothetical protein  42.36 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49781  predicted protein  29.5 
 
 		 418 aa  54.3  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  32 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  31.25 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47724  predicted protein  32.99 
 
 		 646 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642125  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01140  hypothetical protein  26.19 
 
 		 439 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  26.67 
 
 		 271 aa  43.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  27.14 
 
 		 239 aa  43.5  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  28.09 
 
 		 230 aa  42.7  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  28.09 
 
 		 230 aa  42.7  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  31.11 
 
 		 277 aa  42  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>