52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0020 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0020  MOSC domain-containing protein  100 
 
 
145 aa  300  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.606276  hitchhiker  0.0000000172861 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0012  hypothetical protein  97.24 
 
 
145 aa  290  7e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0012  hypothetical protein  96.55 
 
 
145 aa  288  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0018  hypothetical protein  86.9 
 
 
145 aa  261  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0016  hypothetical protein  81.94 
 
 
148 aa  247  5e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0017  hypothetical protein  81.94 
 
 
148 aa  247  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0012  hypothetical protein  81.94 
 
 
148 aa  246  6e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0016  hypothetical protein  81.25 
 
 
148 aa  245  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000149396 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0010  hypothetical protein  78.47 
 
 
150 aa  234  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.276585  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0019  hypothetical protein  67.36 
 
 
146 aa  204  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110253 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0014  hypothetical protein  65.28 
 
 
146 aa  199  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124057  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0010  hypothetical protein  66.43 
 
 
147 aa  194  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0011  hypothetical protein  63.89 
 
 
145 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0016  hypothetical protein  63.19 
 
 
155 aa  191  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000226962 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0012  MOSC domain-containing protein  64.79 
 
 
149 aa  188  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000770125  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2603  MOSC domain-containing protein  41.06 
 
 
151 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10057  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1966  hypothetical protein  39.87 
 
 
156 aa  84  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0292017  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  36.29 
 
 
206 aa  61.6  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  28.28 
 
 
181 aa  60.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  29.17 
 
 
167 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  35.06 
 
 
178 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  30.67 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  30.28 
 
 
184 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0358  MOSC  37.07 
 
 
155 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  29.86 
 
 
182 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  34.88 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  25.34 
 
 
175 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5172  hypothetical protein  26.95 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  34.71 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0430  MOSC domain-containing protein  31.03 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.458415 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  34.29 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  25 
 
 
174 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  24.32 
 
 
177 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1759  MOSC domain-containing protein  23.61 
 
 
142 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188575  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  24.83 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2807  MOSC domain containing protein  26.61 
 
 
549 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0205  MOSC domain containing protein  23.24 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0214556  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2044  MOSC domain-containing protein  23.61 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1690  MOSC domain containing protein  26.39 
 
 
143 aa  45.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0963  MOSC domain-containing protein  29.55 
 
 
221 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58850  hypothetical protein  25.53 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.111042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  27.18 
 
 
174 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3596  MOSC domain containing protein  24.19 
 
 
211 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.564722  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0155  hypothetical protein  29.47 
 
 
205 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1925  hypothetical protein  25 
 
 
226 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1839  3-alpha:MOSC  30.26 
 
 
241 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3230  MOSC domain containing protein  22.5 
 
 
222 aa  41.2  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2705  MOSC domain-containing protein  27.27 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.705945  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2061  hypothetical protein  25.86 
 
 
148 aa  40.4  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000026195  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2403  MOSC domain-containing protein  26.5 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2719  MOSC domain-containing protein  27.27 
 
 
148 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.005456  normal  0.132425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2674  MOSC domain-containing protein  27.27 
 
 
148 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>