62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3279 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3937  hypothetical protein  47.36 
 
 		 718 aa  690    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.631088  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3059  hypothetical protein  74.66 
 
 		 729 aa  1136    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000942986  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0898  hypothetical protein  47.9 
 
 		 718 aa  703    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3639  hypothetical protein  78.07 
 
 		 732 aa  1218    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00188388  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3187  hypothetical protein  48.65 
 
 		 718 aa  698    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.828747 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0757  hypothetical protein  78.61 
 
 		 732 aa  1216    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000601769  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0917  hypothetical protein  48.44 
 
 		 718 aa  714    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.14142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0715  hypothetical protein  78.47 
 
 		 732 aa  1222    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3464  hypothetical protein  48.31 
 
 		 718 aa  709    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0761  hypothetical protein  84.05 
 
 		 740 aa  1303    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000133423  hitchhiker  0.0000000733664 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3279  hypothetical protein  100 
 
 		 734 aa  1524    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00632369  unclonable  0.00000414607 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0642  hypothetical protein  47.16 
 
 		 718 aa  696    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605544  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3582  hypothetical protein  83.45 
 
 		 743 aa  1299    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000436948  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0745  hypothetical protein  78.07 
 
 		 732 aa  1216    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00110202  hitchhiker  0.000231819 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3587  hypothetical protein  48.31 
 
 		 718 aa  709    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115853  normal  0.956669 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3877  hypothetical protein  48.24 
 
 		 718 aa  699    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.286815  hitchhiker  0.0000320991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4208  hypothetical protein  82.03 
 
 		 739 aa  1285    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000122811  hitchhiker  0.000560321 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01009  hypothetical protein  47.28 
 
 		 721 aa  677    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00499323  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0736  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  78.34 
 
 		 732 aa  1219    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00943685  hitchhiker  0.00000000353181 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3388  hypothetical protein  48.17 
 
 		 718 aa  704    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0913  dipeptidyl-peptidase 7  47.36 
 
 		 718 aa  708    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365403  normal  0.893813 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1075  hypothetical protein  47.7 
 
 		 718 aa  710    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3918  hypothetical protein  79.02 
 
 		 732 aa  1228    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0520  hypothetical protein  75.89 
 
 		 731 aa  1165    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00489252  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0684  hypothetical protein  47.23 
 
 		 718 aa  692    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0176519  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2938  hypothetical protein  49.32 
 
 		 738 aa  708    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.0443843 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3025  dipeptidyl-peptidase 7  47.36 
 
 		 718 aa  711    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3249  dipeptidyl-peptidase 7  79.84 
 
 		 732 aa  1234    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0101755  hitchhiker  0.0000935307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0691  dipeptidyl-peptidase 7  79.84 
 
 		 732 aa  1235    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000153124  hitchhiker  0.000504584 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0949  dipeptidyl-peptidase 7  47.36 
 
 		 718 aa  711    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0576142 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0692  hypothetical protein  44.2 
 
 		 731 aa  639    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0573  hypothetical protein  46.96 
 
 		 718 aa  674    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3347  hypothetical protein  73.36 
 
 		 941 aa  1128    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0712  dipeptidyl-peptidase 7  79.7 
 
 		 732 aa  1233    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00861513  hitchhiker  0.000040961 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0807  hypothetical protein  46.69 
 
 		 720 aa  615  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.661422  normal  0.0291008 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02510  hypothetical protein  45.29 
 
 		 707 aa  609  1e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0959  hypothetical protein  44.09 
 
 		 716 aa  609  1e-173  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00114251  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1078  hypothetical protein  43.32 
 
 		 716 aa  606  9.999999999999999e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000205718  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5484  Peptidase S46  39.86 
 
 		 767 aa  523  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3979  hypothetical protein  40.47 
 
 		 715 aa  514  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137716  normal  0.400863 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1344  hypothetical protein  38.27 
 
 		 732 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.818075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5731  Peptidase S46  36.68 
 
 		 786 aa  429  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2038  hypothetical protein  32.56 
 
 		 725 aa  365  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302869  hitchhiker  0.00293045 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0416  hypothetical protein  31.83 
 
 		 714 aa  332  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0905126  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2431  dipeptidyl-peptidase 7  30.94 
 
 		 704 aa  331  3e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2984  hypothetical protein  29.85 
 
 		 722 aa  313  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0404  dipeptidyl-peptidase 7  30.19 
 
 		 714 aa  312  2e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1768  dipeptidyl-peptidase 7  30.66 
 
 		 721 aa  306  1.0000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0506828  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0491  hypothetical protein  30.23 
 
 		 712 aa  298  3e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0849  hypothetical protein  29.35 
 
 		 718 aa  296  6e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1283  hypothetical protein  28.63 
 
 		 720 aa  269  1e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2277  dipeptidyl-peptidase 7  29.17 
 
 		 701 aa  239  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3344  dipeptidyl-peptidase 7  28.67 
 
 		 706 aa  224  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3425  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  28.49 
 
 		 706 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00839556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3489  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  28.22 
 
 		 706 aa  217  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1178  Dipeptidyl-peptidase 7  29.2 
 
 		 751 aa  212  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2591  dipeptidyl-peptidase 7  27.41 
 
 		 714 aa  198  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0494  hypothetical protein  26.34 
 
 		 688 aa  189  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0618  hypothetical protein  25.57 
 
 		 710 aa  185  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5737  Peptidase S46  27.55 
 
 		 711 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654767 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1179  dipeptidyl-peptidase 7  26.09 
 
 		 759 aa  173  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3411  hypothetical protein  35.56 
 
 		 713 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490577  normal  0.207662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>