80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3067 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3067  yecA family protein  100 
 
 		 190 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000104077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3678  YecA family protein  76.8 
 
 		 188 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3973  yecA family protein  74.74 
 
 		 188 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3306  yecA family protein  71.28 
 
 		 191 aa  270  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0830  YgfB and YecA  69.83 
 
 		 191 aa  259  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000149667  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0619  yecA family protein  70.16 
 
 		 191 aa  254  5e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000645729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3334  yecA family protein  69.84 
 
 		 191 aa  254  7e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000512216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3504  yecA family protein  69.63 
 
 		 191 aa  251  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000256627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3214  yecA family protein  69.31 
 
 		 211 aa  250  8.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112455  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3154  yecA family protein  63.35 
 
 		 191 aa  245  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3804  yecA family protein  66.49 
 
 		 191 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0117458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3622  yecA family protein  66.49 
 
 		 191 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.141978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3680  yecA family protein  66.49 
 
 		 191 aa  242  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140016  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0614  yecA family protein  65.97 
 
 		 191 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0814334  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2724  YgfB and YecA  66.29 
 
 		 191 aa  227  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0776  hypothetical protein  68.55 
 
 		 159 aa  206  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0605  yecA family protein  38.12 
 
 		 189 aa  134  9e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00848  yecA family protein  32.39 
 
 		 188 aa  114  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.956  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3503  yecA family protein  32.79 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1270  hypothetical protein  34.46 
 
 		 200 aa  111  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3593  hypothetical protein  35.56 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.927569  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2541  yecA family protein  38.55 
 
 		 191 aa  107  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.0500855 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0683  hypothetical protein  35.98 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000861523  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0859  hypothetical protein  35.23 
 
 		 192 aa  104  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3826  hypothetical protein  35.23 
 
 		 192 aa  104  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000232648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0862  hypothetical protein  35.23 
 
 		 192 aa  104  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000942721  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3295  hypothetical protein  35.39 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00388648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3920  hypothetical protein  37.64 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000119576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3397  hypothetical protein  35.39 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000126267  normal  0.501015 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3218  hypothetical protein  35.39 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000450818  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3230  hypothetical protein  35.39 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000337238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3292  hypothetical protein  35.39 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00367172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3474  hypothetical protein  34.44 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3237  hypothetical protein  34.83 
 
 		 192 aa  98.6  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000591156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3068  hypothetical protein  34.83 
 
 		 192 aa  98.6  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000388648  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0783  yecA family protein  34.83 
 
 		 194 aa  99  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000863734  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02704  hypothetical protein  34.83 
 
 		 192 aa  98.6  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000286708  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4202  hypothetical protein  34.83 
 
 		 192 aa  98.6  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000644534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0800  hypothetical protein  34.83 
 
 		 192 aa  98.6  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000300982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3043  hypothetical protein  34.83 
 
 		 194 aa  99  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000773982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3330  hypothetical protein  34.83 
 
 		 192 aa  98.6  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000429814  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02741  hypothetical protein  34.83 
 
 		 192 aa  98.6  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000279044  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1184  yecA family protein  34.97 
 
 		 184 aa  98.6  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002483  hypothetical protein  32.78 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000288403  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0445  hypothetical protein  33.7 
 
 		 195 aa  96.3  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0282827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0542  hypothetical protein  33.7 
 
 		 195 aa  95.1  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03551  hypothetical protein  32.78 
 
 		 192 aa  94.7  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3328  hypothetical protein  32.02 
 
 		 194 aa  91.3  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000024576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69010  hypothetical protein  32.93 
 
 		 184 aa  89  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5968  hypothetical protein  32.93 
 
 		 184 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2539  hypothetical protein  31.75 
 
 		 189 aa  88.2  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2053  hypothetical protein  28.57 
 
 		 191 aa  87  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119095  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5435  hypothetical protein  32.7 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47340  hypothetical protein  34.21 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0965  hypothetical protein  34.62 
 
 		 185 aa  87  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499984  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1560  YgfB and YecA  32.34 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.272578  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2765  YecA family protein  32.89 
 
 		 182 aa  86.3  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315577  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3428  hypothetical protein  31.58 
 
 		 198 aa  85.5  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1822  protein of unknown function UPF0149  31.25 
 
 		 200 aa  84.3  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0327059  hitchhiker  0.0000000200071 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0847  hypothetical protein  34.62 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.110805  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5224  hypothetical protein  33.14 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5026  hypothetical protein  32.45 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0324  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0320  hypothetical protein  33.15 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.461583 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1769  hypothetical protein  34.97 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.187943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2051  hypothetical protein  34.97 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.399878 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5108  hypothetical protein  32.45 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.217785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5201  hypothetical protein  32.45 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3758  hypothetical protein  28.03 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.434605 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5261  hypothetical protein  30.46 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2578  hypothetical protein  30.77 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.737832  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3514  hypothetical protein  31.45 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00932304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02379  hypothetical protein  32.3 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0090  hypothetical protein  26.25 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0023  hypothetical protein  29.38 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0078  hypothetical protein  25.62 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2771  hypothetical protein  28.95 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0895  hypothetical protein  29.75 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1878  hypothetical protein  31.25 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.781964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3278  hypothetical protein  29.03 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0184151  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>