79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0862 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0859  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  391  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0862  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  391  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000942721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3826  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  391  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000232648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3920  hypothetical protein  83.33 
 
 		 192 aa  317  7.999999999999999e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000119576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3292  hypothetical protein  68.23 
 
 		 192 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00367172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3295  hypothetical protein  68.23 
 
 		 192 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00388648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3230  hypothetical protein  68.23 
 
 		 192 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000337238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3218  hypothetical protein  68.23 
 
 		 192 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000450818  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3397  hypothetical protein  68.23 
 
 		 192 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000126267  normal  0.501015 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3593  hypothetical protein  65.46 
 
 		 196 aa  270  7e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.927569  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3328  hypothetical protein  67.19 
 
 		 194 aa  261  4e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000024576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0800  hypothetical protein  66.67 
 
 		 192 aa  255  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000300982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3237  hypothetical protein  66.67 
 
 		 192 aa  255  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000591156  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3043  hypothetical protein  66.67 
 
 		 194 aa  255  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000773982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3068  hypothetical protein  66.67 
 
 		 192 aa  255  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000388648  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02741  hypothetical protein  66.67 
 
 		 192 aa  255  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000279044  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3330  hypothetical protein  66.67 
 
 		 192 aa  255  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000429814  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02704  hypothetical protein  66.67 
 
 		 192 aa  255  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000286708  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0783  yecA family protein  66.67 
 
 		 194 aa  255  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000863734  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4202  hypothetical protein  66.67 
 
 		 192 aa  255  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000644534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0542  hypothetical protein  71.28 
 
 		 195 aa  249  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0445  hypothetical protein  70.26 
 
 		 195 aa  247  9e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0282827  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3474  hypothetical protein  64.43 
 
 		 196 aa  244  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0683  hypothetical protein  46.43 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000861523  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2053  hypothetical protein  38.86 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119095  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03551  hypothetical protein  39.58 
 
 		 192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002483  hypothetical protein  39.38 
 
 		 192 aa  129  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000288403  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0605  yecA family protein  34.04 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2539  hypothetical protein  37.08 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3306  yecA family protein  37.14 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0830  YgfB and YecA  36.27 
 
 		 191 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000149667  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00848  yecA family protein  37.43 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.956  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3067  yecA family protein  35.23 
 
 		 190 aa  104  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000104077  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1270  hypothetical protein  33.91 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3154  yecA family protein  35.45 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3678  YecA family protein  34.46 
 
 		 188 aa  101  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3973  yecA family protein  35.59 
 
 		 188 aa  100  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0614  yecA family protein  36.63 
 
 		 191 aa  98.6  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0814334  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3680  yecA family protein  36.63 
 
 		 191 aa  98.2  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140016  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3622  yecA family protein  36.63 
 
 		 191 aa  97.8  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.141978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3804  yecA family protein  36.63 
 
 		 191 aa  97.8  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0117458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3334  yecA family protein  36.53 
 
 		 191 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000512216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3214  yecA family protein  34.52 
 
 		 211 aa  96.3  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112455  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3504  yecA family protein  37.65 
 
 		 191 aa  95.9  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000256627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0619  yecA family protein  35.33 
 
 		 191 aa  94.4  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000645729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0965  hypothetical protein  38.24 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499984  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2724  YgfB and YecA  33.68 
 
 		 191 aa  85.9  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0776  hypothetical protein  36.81 
 
 		 159 aa  85.1  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0847  hypothetical protein  37.5 
 
 		 185 aa  84.7  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.110805  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3503  yecA family protein  31.89 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2541  yecA family protein  37.04 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.0500855 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0078  hypothetical protein  28.81 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3428  hypothetical protein  32.37 
 
 		 198 aa  72  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0090  hypothetical protein  28.81 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5435  hypothetical protein  31.61 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0320  hypothetical protein  32.83 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.461583 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02379  hypothetical protein  33.93 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5224  hypothetical protein  33.67 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1184  yecA family protein  32.54 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69010  hypothetical protein  29.38 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5968  hypothetical protein  29.9 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2771  hypothetical protein  30.98 
 
 		 178 aa  67  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1822  protein of unknown function UPF0149  34.46 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0327059  hitchhiker  0.0000000200071 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5108  hypothetical protein  31.61 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.217785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5201  hypothetical protein  31.61 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5026  hypothetical protein  31.09 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5261  hypothetical protein  31.49 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3278  hypothetical protein  31.64 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0184151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2765  YecA family protein  29.65 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315577  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47340  hypothetical protein  30.81 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1560  YgfB and YecA  25 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.272578  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0324  hypothetical protein  33.54 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3514  hypothetical protein  31.52 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00932304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3758  hypothetical protein  24.19 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.434605 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0895  hypothetical protein  27.78 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1769  hypothetical protein  24.68 
 
 		 217 aa  51.2  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.187943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2051  hypothetical protein  24.68 
 
 		 217 aa  51.2  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.399878 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1878  hypothetical protein  24.52 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.781964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2578  hypothetical protein  27.33 
 
 		 176 aa  41.6  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.737832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>