282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1835 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1835  glutaredoxin-like protein  100 
 
 		 116 aa  242  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal  0.937939 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2160  glutaredoxin-like protein  91.23 
 
 		 116 aa  222  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.277546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2444  glutaredoxin-like protein  90.27 
 
 		 115 aa  217  5e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72039  normal  0.0565869 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1964  glutaredoxin-like protein  90.18 
 
 		 113 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0459539  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1573  glutaredoxin-like protein  88.07 
 
 		 110 aa  202  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000259728  normal  0.0657649 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1648  glutaredoxin-like protein  88.07 
 
 		 110 aa  202  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000432966  hitchhiker  0.000256673 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1640  glutaredoxin-like protein  88.07 
 
 		 110 aa  202  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000581694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1688  glutaredoxin-like protein  87.16 
 
 		 110 aa  202  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296306  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1919  glutaredoxin-related protein  86.24 
 
 		 110 aa  201  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00265167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1748  glutaredoxin-like protein  83.64 
 
 		 113 aa  201  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425193  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1640  glutaredoxin-like protein  86.67 
 
 		 111 aa  199  7e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000518322  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2880  glutaredoxin domain-containing protein  86.24 
 
 		 110 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1820  glutaredoxin-like protein  85.32 
 
 		 110 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000369012  normal  0.269643 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1783  glutaredoxin-like protein  84.4 
 
 		 110 aa  197  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000151147  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1776  glutaredoxin-like protein  84.4 
 
 		 110 aa  197  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000936402  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2502  glutaredoxin-like protein  84.4 
 
 		 110 aa  197  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000230073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1631  hypothetical protein  77.06 
 
 		 110 aa  187  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000352705  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01624  hypothetical protein  74.77 
 
 		 115 aa  185  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.521708  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1986  glutaredoxin-like protein  74.77 
 
 		 115 aa  185  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.235572  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1529  hypothetical protein  75.68 
 
 		 115 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1741  hypothetical protein  75.68 
 
 		 115 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000591153  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01614  hypothetical protein  74.77 
 
 		 115 aa  185  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1603  hypothetical protein  75.68 
 
 		 115 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1544  hypothetical protein  74.77 
 
 		 115 aa  185  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2366  hypothetical protein  74.77 
 
 		 115 aa  185  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00389248  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1910  hypothetical protein  75.68 
 
 		 115 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1975  hypothetical protein  74.77 
 
 		 115 aa  185  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010307 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1732  hypothetical protein  74.77 
 
 		 115 aa  185  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.358242  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1850  hypothetical protein  74.77 
 
 		 115 aa  185  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478311  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1866  hypothetical protein  74.77 
 
 		 115 aa  185  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000387905  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1543  hypothetical protein  75.68 
 
 		 115 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1793  hypothetical protein  73.87 
 
 		 115 aa  184  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.169606  normal  0.0260358 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2670  hypothetical protein  72.57 
 
 		 116 aa  184  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0262215  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1718  hypothetical protein  73.45 
 
 		 116 aa  184  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000856261  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1686  glutaredoxin-like protein  74.55 
 
 		 114 aa  183  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2386  hypothetical protein  72.57 
 
 		 116 aa  183  8e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0290699  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1758  hypothetical protein  72.73 
 
 		 116 aa  182  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225662  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002935  glutaredoxin-related protein  75.93 
 
 		 116 aa  181  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000192998  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1866  hypothetical protein  72.73 
 
 		 116 aa  182  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.252998  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2569  hypothetical protein  72.73 
 
 		 116 aa  182  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0109727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02749  putative glutaredoxin like protein  70.69 
 
 		 116 aa  181  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03013  hypothetical protein  75 
 
 		 116 aa  179  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2198  hypothetical protein  71.82 
 
 		 115 aa  179  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390421  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1396  glutaredoxin-like protein  71.3 
 
 		 109 aa  179  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.420177  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1034  glutaredoxin-like protein  71.43 
 
 		 108 aa  178  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000907202  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1859  putative glutaredoxin  73.58 
 
 		 111 aa  173  8e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3475  glutaredoxin,-like protein  73.47 
 
 		 116 aa  169  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1614  hypothetical protein  70.19 
 
 		 108 aa  168  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18650  hypothetical protein  70.19 
 
 		 108 aa  168  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0667348 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2449  glutaredoxin-like protein  66.67 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.182264  normal  0.0446478 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3339  glutaredoxin-like protein  68.27 
 
 		 108 aa  164  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0384172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2129  glutaredoxin-like protein  66.99 
 
 		 112 aa  160  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0086  glutaredoxin-related protein  64.81 
 
 		 119 aa  157  6e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0938468  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3388  glutaredoxin-like protein  62.86 
 
 		 109 aa  156  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.459255  normal  0.239887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1081  glutaredoxin-related protein  67 
 
 		 111 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.581257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1110  glutaredoxin-like protein  66 
 
 		 111 aa  153  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1122  glutaredoxin-like protein  67.35 
 
 		 152 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4161  glutaredoxin-related protein  60.75 
 
 		 108 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4524  glutaredoxin-like protein  65 
 
 		 113 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532221  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14040  Glutaredoxin4 protein  63.46 
 
 		 108 aa  151  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3898  glutaredoxin-like protein  60.75 
 
 		 108 aa  150  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.713119 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4331  glutaredoxin-like protein  66.33 
 
 		 111 aa  150  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.488621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2438  glutaredoxin-related protein  62.5 
 
 		 110 aa  150  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000187955  normal  0.0679264 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3038  glutaredoxin-like protein  60.19 
 
 		 115 aa  144  6e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2896  glutaredoxin-like protein  60.19 
 
 		 115 aa  144  6e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2427  glutaredoxin-like protein  50.93 
 
 		 110 aa  137  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17903  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0963  glutaredoxin-like protein  55.67 
 
 		 111 aa  133  7.000000000000001e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000957456 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1242  glutaredoxin-related protein  53.54 
 
 		 116 aa  130  7.999999999999999e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.828915 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1150  glutaredoxin-like protein  53.54 
 
 		 116 aa  130  7.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2078  glutaredoxin-related protein  51.52 
 
 		 110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0596  glutaredoxin-like protein  53.54 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.097988  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2316  glutaredoxin-like protein  50 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0729  glutaredoxin-like protein  51.89 
 
 		 111 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0595  glutaredoxin-like protein  52.34 
 
 		 109 aa  128  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0120135  hitchhiker  6.40079e-17 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1149  glutaredoxin-like protein  51.02 
 
 		 112 aa  126  8.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0349  glutaredoxin-like protein  44.34 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.508433 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2460  glutaredoxin-like protein  46.15 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2499  glutaredoxin-like protein  53.54 
 
 		 106 aa  122  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01315  putative glutaredoxin-like protein  45 
 
 		 106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.359363  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2667  glutaredoxin-like protein  46.79 
 
 		 115 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.144494  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2639  glutaredoxin-like protein  50.46 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.49425  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0245  glutaredoxin-like protein  50.93 
 
 		 105 aa  118  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.254771  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51060  glutaredoxin-related protein  51.96 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0783867  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5883  putative glutaredoxin family protein  48.08 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0738843  normal  0.762824 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1641  glutaredoxin-like protein  47.37 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0491  glutaredoxin-related protein  46.39 
 
 		 107 aa  114  3e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.249105  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1312  glutaredoxin-like protein  44.12 
 
 		 112 aa  114  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0591  glutaredoxin-like protein  50 
 
 		 107 aa  114  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1599  glutaredoxin-like protein  45.54 
 
 		 123 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.283027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2890  glutaredoxin-like protein  49 
 
 		 103 aa  114  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.441106 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1480  glutaredoxin  46.32 
 
 		 99 aa  114  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.516796  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0697  glutaredoxin family protein  45.26 
 
 		 99 aa  114  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000299958  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2519  glutaredoxin-like protein  43.52 
 
 		 109 aa  113  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134397  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0302  glutaredoxin-related protein  45.54 
 
 		 110 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.354475  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0259  glutaredoxin-related protein  49.02 
 
 		 110 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2647  glutaredoxin-like protein  45.19 
 
 		 110 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3038  glutaredoxin-related protein  45.19 
 
 		 110 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3466  glutaredoxin-like protein  46.08 
 
 		 113 aa  113  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2932  glutaredoxin-related protein  47 
 
 		 102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3592  putative glutaredoxin  47 
 
 		 102 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.703507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>