242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0596 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0596  glutaredoxin-like protein  100 
 
 
115 aa  241  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.097988  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1149  glutaredoxin-like protein  64.36 
 
 
112 aa  142  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0349  glutaredoxin-like protein  58.82 
 
 
109 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.508433 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2460  glutaredoxin-like protein  59.8 
 
 
109 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1631  hypothetical protein  56.44 
 
 
110 aa  134  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000352705  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02749  putative glutaredoxin like protein  51.3 
 
 
116 aa  134  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03013  hypothetical protein  50.43 
 
 
116 aa  134  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002935  glutaredoxin-related protein  48.7 
 
 
116 aa  133  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000192998  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1776  glutaredoxin-like protein  50.93 
 
 
110 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000936402  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1783  glutaredoxin-like protein  50.93 
 
 
110 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000151147  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1396  glutaredoxin-like protein  48.15 
 
 
109 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.420177  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2502  glutaredoxin-like protein  50.93 
 
 
110 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000230073  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1820  glutaredoxin-like protein  50 
 
 
110 aa  131  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000369012  normal  0.269643 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2449  glutaredoxin-like protein  51.89 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.182264  normal  0.0446478 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1859  putative glutaredoxin  51.38 
 
 
111 aa  130  6e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1688  glutaredoxin-like protein  52.43 
 
 
110 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296306  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1640  glutaredoxin-like protein  49.54 
 
 
111 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000518322  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1866  hypothetical protein  50 
 
 
116 aa  130  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.252998  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2569  hypothetical protein  50 
 
 
116 aa  130  9e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0109727  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1758  hypothetical protein  50 
 
 
116 aa  130  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225662  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3475  glutaredoxin,-like protein  53.06 
 
 
116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1835  glutaredoxin-like protein  53.54 
 
 
116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal  0.937939 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2499  glutaredoxin-like protein  60.19 
 
 
106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2129  glutaredoxin-like protein  52.34 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1573  glutaredoxin-like protein  54.08 
 
 
110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000259728  normal  0.0657649 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1648  glutaredoxin-like protein  54.08 
 
 
110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000432966  hitchhiker  0.000256673 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1748  glutaredoxin-like protein  50 
 
 
113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425193  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1640  glutaredoxin-like protein  54.08 
 
 
110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000581694  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1919  glutaredoxin-related protein  53.06 
 
 
110 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00265167  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2316  glutaredoxin-like protein  54.63 
 
 
129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2427  glutaredoxin-like protein  52.29 
 
 
110 aa  128  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17903  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3388  glutaredoxin-like protein  53 
 
 
109 aa  128  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.459255  normal  0.239887 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2880  glutaredoxin domain-containing protein  51.46 
 
 
110 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2160  glutaredoxin-like protein  52 
 
 
116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.277546  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18650  hypothetical protein  53.77 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0667348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1614  hypothetical protein  53.77 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2444  glutaredoxin-like protein  52 
 
 
115 aa  127  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72039  normal  0.0565869 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2198  hypothetical protein  46.73 
 
 
115 aa  127  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390421  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2670  hypothetical protein  51.55 
 
 
116 aa  126  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0262215  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01624  hypothetical protein  50.52 
 
 
115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.521708  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1986  glutaredoxin-like protein  50.52 
 
 
115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.235572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1732  hypothetical protein  50.52 
 
 
115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.358242  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1544  hypothetical protein  50.52 
 
 
115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1686  glutaredoxin-like protein  51.55 
 
 
114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1718  hypothetical protein  51.55 
 
 
116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000856261  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1975  hypothetical protein  50.52 
 
 
115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010307 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1850  hypothetical protein  50.52 
 
 
115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478311  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01614  hypothetical protein  50.52 
 
 
115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2366  hypothetical protein  50.52 
 
 
115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00389248  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1964  glutaredoxin-like protein  53.06 
 
 
113 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0459539  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2386  hypothetical protein  48.62 
 
 
116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0290699  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1866  hypothetical protein  50.52 
 
 
115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000387905  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1603  hypothetical protein  50.52 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1741  hypothetical protein  50.52 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000591153  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1543  hypothetical protein  50.52 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416029  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1910  hypothetical protein  50.52 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1529  hypothetical protein  50.52 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1793  hypothetical protein  50.52 
 
 
115 aa  124  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.169606  normal  0.0260358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1081  glutaredoxin-related protein  53.06 
 
 
111 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.581257  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4331  glutaredoxin-like protein  53.06 
 
 
111 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.488621  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3898  glutaredoxin-like protein  47.66 
 
 
108 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.713119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1110  glutaredoxin-like protein  52.04 
 
 
111 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1122  glutaredoxin-like protein  53.06 
 
 
152 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3339  glutaredoxin-like protein  52.48 
 
 
108 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0384172  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1034  glutaredoxin-like protein  48.51 
 
 
108 aa  121  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000907202  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2438  glutaredoxin-related protein  46.79 
 
 
110 aa  120  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000187955  normal  0.0679264 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0259  glutaredoxin-related protein  55.79 
 
 
110 aa  120  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0963  glutaredoxin-like protein  49.09 
 
 
111 aa  120  6e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000957456 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14040  Glutaredoxin4 protein  49.51 
 
 
108 aa  120  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4161  glutaredoxin-related protein  46.73 
 
 
108 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4524  glutaredoxin-like protein  51.02 
 
 
113 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532221  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0729  glutaredoxin-like protein  51.49 
 
 
111 aa  118  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01315  putative glutaredoxin-like protein  52.48 
 
 
106 aa  118  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.359363  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3038  glutaredoxin-like protein  48.08 
 
 
115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2896  glutaredoxin-like protein  48.08 
 
 
115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0595  glutaredoxin-like protein  49.5 
 
 
109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0120135  hitchhiker  6.40079e-17 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51060  glutaredoxin-related protein  51.92 
 
 
109 aa  116  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0783867  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2078  glutaredoxin-related protein  49.04 
 
 
110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1242  glutaredoxin-related protein  50.54 
 
 
116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.828915 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1150  glutaredoxin-like protein  50.54 
 
 
116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37615  glutaredoxin  50 
 
 
149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2225  monothiol glutaredoxin  47.06 
 
 
104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0086  glutaredoxin-related protein  41 
 
 
119 aa  110  9e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0938468  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3370  glutaredoxin-like protein  51.55 
 
 
308 aa  108  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.616165 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2134  glutaredoxin-like protein  46.08 
 
 
104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.681937  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1374  glutaredoxin-like protein  48.08 
 
 
106 aa  107  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.431306  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0011  glutaredoxin-like protein  47.62 
 
 
112 aa  105  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1610  glutaredoxin-like protein  46.15 
 
 
135 aa  106  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2647  glutaredoxin-like protein  49 
 
 
110 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48859  predicted protein  46.85 
 
 
134 aa  105  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.815373  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3038  glutaredoxin-related protein  49 
 
 
110 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5883  putative glutaredoxin family protein  45.92 
 
 
109 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0738843  normal  0.762824 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1116  glutaredoxin-like protein  48.57 
 
 
120 aa  105  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1710  putative monothiol glutaredoxin  48.11 
 
 
120 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0700819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0007  glutaredoxin-like protein  47.17 
 
 
112 aa  104  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1426  glutaredoxin-like protein  50 
 
 
109 aa  104  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495839  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2171  glutaredoxin-like protein  45.71 
 
 
119 aa  104  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.95609  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1124  glutaredoxin-like protein  46.15 
 
 
112 aa  104  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0705  glutaredoxin-like protein  46.46 
 
 
109 aa  102  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0245  glutaredoxin-like protein  49.51 
 
 
105 aa  102  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.254771  normal  0.100624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>