49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1439 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1439  protein of unknown function SprT  100 
 
 		 193 aa  387  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676682 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3228  protein of unknown function DUF335, SprT  32.58 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03570  hypothetical protein  35.9 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002465  protein SprT  30.77 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33250  hypothetical protein  27.55 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.115665  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4247  hypothetical protein  31.37 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.397141 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2229  protein of unknown function DUF335 SprT  27.27 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.354031  normal  0.796923 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4234  hypothetical protein  27.66 
 
 		 164 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3086  hypothetical protein  30.39 
 
 		 165 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0374593  hitchhiker  0.00021739 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3348  hypothetical protein  30.39 
 
 		 165 aa  45.1  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000288279  decreased coverage  0.00213814 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3287  hypothetical protein  30.39 
 
 		 165 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.717112  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0551  hypothetical protein  31.68 
 
 		 161 aa  44.7  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0324  protein of unknown function DUF335 SprT  34.48 
 
 		 196 aa  44.7  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0077532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3376  hypothetical protein  29.41 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0770  hypothetical protein  29.41 
 
 		 151 aa  44.3  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000227359  hitchhiker  0.0000931266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1241  hypothetical protein  26.79 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000128773 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02774  hypothetical protein  29.41 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.110605  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3102  hypothetical protein  29.41 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0501  hypothetical protein  41.46 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00000572187  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02737  hypothetical protein  29.41 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0751  protein of unknown function DUF335 SprT  29.41 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.067857  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0505  hypothetical protein  41.27 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000160029  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1639  hypothetical protein  26.02 
 
 		 164 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3435  hypothetical protein  30.39 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0526499  hitchhiker  0.00365775 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3255  hypothetical protein  30.39 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000006136  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3266  hypothetical protein  30.39 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.005885  normal  0.0446452 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3331  hypothetical protein  30.39 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10575  normal  0.425008 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3339  hypothetical protein  30.39 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00105383  normal  0.150558 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1683  peptidase, SprT family  28.72 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.781786  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3706  hypothetical protein  30.23 
 
 		 164 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100473 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3222  protein of unknown function DUF335, SprT  32.48 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00097264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0451  hypothetical protein  34.72 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3970  protein of unknown function DUF335, SprT  50 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4078  hypothetical protein  26.02 
 
 		 164 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1201  hypothetical protein  26.79 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2368  protein of unknown function DUF335, SprT  30.86 
 
 		 176 aa  43.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0781299  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3906  hypothetical protein  35.14 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000939538  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0548  hypothetical protein  38.1 
 
 		 170 aa  42  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000220186  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3708  hypothetical protein  35.14 
 
 		 170 aa  42  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000576402  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0602  protein of unknown function DUF335 SprT  48.84 
 
 		 188 aa  41.6  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0842  hypothetical protein  39.22 
 
 		 187 aa  42  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000365146  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3346  hypothetical protein  39.22 
 
 		 187 aa  42  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0840  hypothetical protein  29.41 
 
 		 170 aa  42  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0023  hypothetical protein  38.1 
 
 		 162 aa  42  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49060  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  42  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203632  hitchhiker  0.000000135384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4190  hypothetical protein  47.06 
 
 		 165 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05440  hypothetical protein  30.43 
 
 		 199 aa  41.6  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0577  sprT protein, putative  36.99 
 
 		 184 aa  41.6  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00218492  normal  0.10682 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2972  hypothetical protein  48.89 
 
 		 219 aa  41.2  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.609934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>