49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1665 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1665  putative adenylyl cyclase CyaB  100 
 
 		 183 aa  380  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1784  putative adenylyl cyclase CyaB  69.06 
 
 		 194 aa  274  5e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0024  adenylate cyclase  67.98 
 
 		 183 aa  262  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0940  putative adenylyl cyclase CyaB  63.19 
 
 		 185 aa  250  6e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02204  hypothetical protein  60.11 
 
 		 182 aa  241  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3778  adenylate cyclase CyaB, putative  60.12 
 
 		 194 aa  228  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1050  putative adenylate cyclase CyaB  59.43 
 
 		 185 aa  228  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0910  putative adenylyl cyclase CyaB  56.07 
 
 		 195 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3104  putative adenylyl cyclase CyaB  58.38 
 
 		 197 aa  217  6e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0901  adenylyl cyclase CyaB  56.07 
 
 		 195 aa  216  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3461  putative adenylyl cyclase CyaB  56.07 
 
 		 195 aa  215  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0875  putative adenylyl cyclase CyaB  56.07 
 
 		 195 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1517  putative adenylyl cyclase CyaB  56.18 
 
 		 193 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000378541  normal  0.664583 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0842  putative adenylyl cyclase CyaB  57.8 
 
 		 204 aa  205  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.112196 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3125  putative adenylyl cyclase CyaB  57.8 
 
 		 204 aa  204  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0814  putative adenylyl cyclase CyaB  56.42 
 
 		 213 aa  203  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1537  adenylyl cyclase CyaB  47.43 
 
 		 180 aa  173  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2924  adenylyl cyclase CyaB  48.57 
 
 		 180 aa  173  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.880007  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1350  adenylate cyclase 2  47.16 
 
 		 179 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0174263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2804  adenylate cyclase, class IV  47.16 
 
 		 179 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2407  adenylyl cyclase CyaB  46.29 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308065  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2502  adenylyl cyclase CyaB  45.71 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0623  adenylyl cyclase CyaB  28.41 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0548  adenylate cyclase  26.97 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0735  putative adenylyl cyclase CyaB  23.86 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00219376 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1147  hypothetical protein  25.68 
 
 		 199 aa  50.8  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1114  putative adenylyl cyclase CyaB  26.29 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.643274 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0317  putative adenylyl cyclase CyaB  25.14 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.604366  normal  0.0901791 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1326  putative adenylyl cyclase CyaB  25.71 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.422285 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0006  adenylate cyclase  31.58 
 
 		 182 aa  48.5  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.136902 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2305  adenylyl cyclase CyaB  25.53 
 
 		 181 aa  48.9  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0126885  normal  0.751604 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1595  adenylyl cyclase CyaB  24.58 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0248189  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0530  putative adenylyl cyclase CyaB  24.02 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0808  putative adenylyl cyclase CyaB  28.17 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0805  adenylyl cyclase CyaB  25.13 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.763555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0631  adenylate cyclase  25.57 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1167  adenylyl cyclase CyaB, putative  20.77 
 
 		 175 aa  44.7  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0038  putative adenylyl cyclase CyaB  26.23 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.318646  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0933  putative adenylyl cyclase CyaB  21.48 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.164628  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1935  adenylate cyclase  25.53 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00466325  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0514  adenylyl cyclase CyaB  21.74 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11960  adenylate cyclase, class 2 (thermophilic)  25.96 
 
 		 142 aa  42.4  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.936379 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3048  adenylate cyclase  25.28 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.128686  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0067  adenylyl cyclase CyaB  29.41 
 
 		 176 aa  42  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.160565  normal  0.206262 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0075  putative adenylyl cyclase CyaB  27.5 
 
 		 176 aa  41.6  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.109831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0386  putative adenylyl cyclase CyaB  24.73 
 
 		 186 aa  41.6  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0190069  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0056  adenylate cyclase  27.66 
 
 		 172 aa  41.2  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0323  adenylyl cyclase CyaB  31.71 
 
 		 172 aa  41.2  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.362109  normal  0.0195848 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0037  adenylate cyclase  25.32 
 
 		 176 aa  41.2  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>