79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3230 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3295  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  397  1e-110  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00388648  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3218  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  397  1e-110  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  4.50818e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3230  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  397  1e-110  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  3.37238e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3292  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  397  1e-110  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00367172  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3397  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  397  1e-110  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  1.26267e-05  normal  0.501015 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3043  hypothetical protein  93.23 
 
 
194 aa  355  3e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  7.73982e-06  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02741  hypothetical protein  93.23 
 
 
192 aa  355  3e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.79044e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0800  hypothetical protein  93.23 
 
 
192 aa  355  3e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  3.00982e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3237  hypothetical protein  93.23 
 
 
192 aa  355  3e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  5.91156e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3068  hypothetical protein  93.23 
 
 
192 aa  355  3e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.88648e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3330  hypothetical protein  93.23 
 
 
192 aa  355  3e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.29814e-13  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0783  yecA family protein  93.23 
 
 
194 aa  355  3e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  8.63734e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02704  hypothetical protein  93.23 
 
 
192 aa  355  3e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  2.86708e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4202  hypothetical protein  93.23 
 
 
192 aa  355  3e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  6.44534e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3328  hypothetical protein  91.15 
 
 
194 aa  352  3e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  2.4576e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0859  hypothetical protein  68.23 
 
 
192 aa  283  1e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.8893e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3826  hypothetical protein  68.23 
 
 
192 aa  283  1e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.32648e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0862  hypothetical protein  68.23 
 
 
192 aa  283  1e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  9.42721e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3593  hypothetical protein  64.43 
 
 
196 aa  263  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.927569  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3920  hypothetical protein  66.67 
 
 
192 aa  256  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.19576e-07  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3474  hypothetical protein  65.98 
 
 
196 aa  247  6e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0542  hypothetical protein  69.23 
 
 
195 aa  246  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0445  hypothetical protein  67.69 
 
 
195 aa  243  9e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0282827  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0683  hypothetical protein  51.19 
 
 
185 aa  169  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  8.61523e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0605  yecA family protein  34.57 
 
 
189 aa  127  7e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2053  hypothetical protein  36.79 
 
 
191 aa  124  8e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.19095e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03551  hypothetical protein  35.45 
 
 
192 aa  113  1e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002483  hypothetical protein  34.39 
 
 
192 aa  112  2e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  2.88403e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3154  yecA family protein  35.52 
 
 
191 aa  110  1e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3306  yecA family protein  39.88 
 
 
191 aa  106  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0830  YgfB and YecA  36.9 
 
 
191 aa  104  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.49667e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2539  hypothetical protein  38.24 
 
 
189 aa  104  9e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3067  yecA family protein  35.39 
 
 
190 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000104077  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3678  YecA family protein  35.26 
 
 
188 aa  97.1  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3973  yecA family protein  35.5 
 
 
188 aa  97.1  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1270  hypothetical protein  35.76 
 
 
200 aa  95.5  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3334  yecA family protein  35.8 
 
 
191 aa  95.1  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  5.12216e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0614  yecA family protein  34.13 
 
 
191 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0814334  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3804  yecA family protein  34.13 
 
 
191 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0117458  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3622  yecA family protein  34.13 
 
 
191 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.141978  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3680  yecA family protein  34.13 
 
 
191 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140016  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00848  yecA family protein  33.33 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.956  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3504  yecA family protein  35.19 
 
 
191 aa  92.4  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000256627  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0619  yecA family protein  35.19 
 
 
191 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  6.45729e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3214  yecA family protein  35.33 
 
 
211 aa  90.9  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112455  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2724  YgfB and YecA  34.59 
 
 
191 aa  82.4  4e-15  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0965  hypothetical protein  36.99 
 
 
185 aa  82  5e-15  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499984  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0776  hypothetical protein  35.42 
 
 
159 aa  82  5e-15  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3503  yecA family protein  28.12 
 
 
189 aa  81.6  6e-15  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0847  hypothetical protein  36.84 
 
 
185 aa  81.3  8e-15  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.110805  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2541  yecA family protein  32.98 
 
 
191 aa  81.3  8e-15  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.0500855 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5968  hypothetical protein  31.96 
 
 
184 aa  79.3  3e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0320  hypothetical protein  34.34 
 
 
189 aa  79  4e-14  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.461583 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69010  hypothetical protein  31.44 
 
 
184 aa  79  4e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1184  yecA family protein  32.04 
 
 
184 aa  77.4  1e-13  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5224  hypothetical protein  33.67 
 
 
184 aa  76.3  2e-13  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5435  hypothetical protein  32 
 
 
186 aa  73.9  1e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5108  hypothetical protein  33.14 
 
 
184 aa  68.9  4e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.217785  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5201  hypothetical protein  33.14 
 
 
184 aa  68.9  4e-11  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2765  YecA family protein  33.14 
 
 
182 aa  66.2  3e-10  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315577  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3428  hypothetical protein  31.79 
 
 
198 aa  65.1  5e-10  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02379  hypothetical protein  33.14 
 
 
188 aa  65.1  6e-10  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2771  hypothetical protein  28.26 
 
 
178 aa  63.9  1e-09  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5261  hypothetical protein  31.95 
 
 
184 aa  63.2  2e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1560  YgfB and YecA  27.1 
 
 
194 aa  62  5e-09  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.272578  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3514  hypothetical protein  30.85 
 
 
197 aa  61.6  7e-09  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00932304  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47340  hypothetical protein  31.72 
 
 
184 aa  61.2  8e-09  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3278  hypothetical protein  34.29 
 
 
182 aa  60.5  1e-08  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0184151  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1822  protein of unknown function UPF0149  33.52 
 
 
200 aa  60.1  2e-08  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0327059  hitchhiker  2.00071e-08 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5026  hypothetical protein  30.26 
 
 
184 aa  60.1  2e-08  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0078  hypothetical protein  24.86 
 
 
193 aa  59.3  3e-08  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0895  hypothetical protein  30.39 
 
 
186 aa  58.9  5e-08  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0090  hypothetical protein  24.86 
 
 
193 aa  58.5  5e-08  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0324  hypothetical protein  33.99 
 
 
184 aa  58.2  7e-08  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2051  hypothetical protein  26.32 
 
 
217 aa  53.5  2e-06  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.399878 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1769  hypothetical protein  26.32 
 
 
217 aa  53.5  2e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.187943  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3758  hypothetical protein  25.86 
 
 
196 aa  52  5e-06  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.434605 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1878  hypothetical protein  25.86 
 
 
218 aa  48.1  8e-05  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.781964  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2578  hypothetical protein  27.45 
 
 
176 aa  46.2  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.737832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>