69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_B0115 on replicon NC_011204
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011204  SeD_B0115  putative stability protein StbE  100 
 
 		 93 aa  187  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000821269  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1655  putative stability protein StbE  66.67 
 
 		 94 aa  133  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1721  putative stability protein StbE  66.67 
 
 		 94 aa  131  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1619  putative stability protein StbE  67.78 
 
 		 94 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.476443  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0319  addiction module toxin, RelE/StbE family  65.52 
 
 		 95 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0691287  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2079  addiction module toxin, RelE/StbE family  70 
 
 		 95 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00218718  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2072  addiction module antitoxin  70 
 
 		 95 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0018  toxin RelE  70 
 
 		 95 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5382  addiction module antitoxin  66.67 
 
 		 93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.584673 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3785  stability protein StbE  65.56 
 
 		 96 aa  125  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3688  addiction module antitoxin  64.52 
 
 		 95 aa  124  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125211  normal  0.144102 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1012  addiction module toxin, RelE/StbE family  63.44 
 
 		 93 aa  122  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.247568  hitchhiker  0.000000000573461 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0890  stability protein StbE, putative  63.44 
 
 		 93 aa  122  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0708  addiction module toxin, RelE/StbE family  64.52 
 
 		 94 aa  122  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4836  addiction module antitoxin  65.56 
 
 		 93 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0435  addiction module antitoxin  66.67 
 
 		 94 aa  118  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4716  addiction module toxin RelE  63.44 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1469  putative plasmid stabilisation system protein  62.22 
 
 		 94 aa  117  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.165331  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2227  addiction module antitoxin  61.29 
 
 		 94 aa  117  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0239944  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0823  hypothetical protein  62.22 
 
 		 96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.382841  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4314  addiction module antitoxin  56.99 
 
 		 95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100162  hitchhiker  0.0025912 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3849  addiction module antitoxin  60 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000246767 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4546  addiction module antitoxin  62.22 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.747035  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2439  RelE protein  60.22 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193835  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4647  addiction module antitoxin  59.14 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4185  addiction module toxin, RelE/StbE family  55.91 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4332  addiction module toxin, RelE/StbE family  59.14 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4397  addiction module antitoxin  59.14 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  0.935834 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4469  addiction module toxin, RelE/StbE family  59.14 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505994  normal  0.573834 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0794  hypothetical protein  59.09 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.385271  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2258  addiction module toxin, RelE/StbE family  61.11 
 
 		 95 aa  108  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000447442  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4830  putative stability protein StbE  63.44 
 
 		 94 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0089  hypothetical protein  58.51 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.735538  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5387  stability cassette protein, putative  66.67 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0155  plasmid stabilization system protein  67.12 
 
 		 77 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.123434 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4701  putative stability protein StbE  63.44 
 
 		 94 aa  103  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.86483 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4796  putative stability protein StbE  62.37 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4851  putative stability protein StbE  62.37 
 
 		 94 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3376  addiction module antitoxin  56.63 
 
 		 88 aa  100  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3833  plasmid stabilization system protein  59.14 
 
 		 96 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44980  Cytotoxin, RelE protein  62.37 
 
 		 93 aa  98.2  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1588  hypothetical protein  63.01 
 
 		 85 aa  97.8  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1073  addiction module toxin, RelE/StbE family  53.26 
 
 		 114 aa  97.8  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.588523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1758  addiction module toxin, RelE/StbE family  53.26 
 
 		 114 aa  97.8  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.532041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5502  plasmid stabilization system protein  66.67 
 
 		 72 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.518192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5358  plasmid stabilization system protein  66.67 
 
 		 72 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2746  addiction module toxin, RelE/StbE family  51.69 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00613  putative relE protein  60 
 
 		 97 aa  82.8  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.164171  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1208  plasmid stabilization system protein  62.5 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1119  addiction module toxin, RelE/StbE  60.92 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.197659  normal  0.189109 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1266  hypothetical protein  60.92 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0704408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0244  addiction module toxin, RelE/StbE family  47.19 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4264  hypothetical protein  80 
 
 		 49 aa  65.9  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4228  hypothetical protein  80 
 
 		 49 aa  65.9  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4769  plasmid stabilization system protein  65.96 
 
 		 50 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3603  prevent-host-death family protein  38.82 
 
 		 176 aa  62  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0840  putative inner membrane protein  71.43 
 
 		 61 aa  57  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4227  hypothetical protein  74.29 
 
 		 35 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4263  hypothetical protein  74.29 
 
 		 35 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  31.71 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1483  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.49 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0031992  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0380  RelE/StbE family addiction module toxin  34.12 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1997  addiction module antitoxin  61.11 
 
 		 37 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.67699  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3196  plasmid stabilization system protein  35.16 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  34.44 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.46 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1376  addiction module antitoxin  34.44 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03534  hypothetical protein  58.06 
 
 		 48 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0782  plasmid stabilization system  32.14 
 
 		 85 aa  40  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00543713  normal  0.858319 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>