86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4803 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4803  DNA methylase  100 
 
 		 322 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0407  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  60.44 
 
 		 338 aa  418  1e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0646308  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1044  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  48.87 
 
 		 330 aa  312  4.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3014  DNA methylase N-4/N-6  46.13 
 
 		 301 aa  281  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.718378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4304  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.58 
 
 		 874 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3185  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.98 
 
 		 394 aa  256  5e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1593  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.65 
 
 		 308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0446322  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0454  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.65 
 
 		 329 aa  229  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.558336  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3519  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40 
 
 		 331 aa  226  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000244279  normal  0.486943 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3337  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.88 
 
 		 345 aa  223  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149909  unclonable  0.0000000199825 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.79 
 
 		 313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.304507 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4481  DNA methylase N-4/N-6  27.81 
 
 		 416 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4984  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.19 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.677083  normal  0.015231 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5389  DNA methylase N-4/N-6  24.29 
 
 		 355 aa  95.9  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.352939 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0277  hypothetical protein  26.85 
 
 		 413 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.294361  normal  0.0427595 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.98 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.35 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.02 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.3 
 
 		 597 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.48 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2333  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.09 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0137927 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0627  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.86 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1221  modification methylase, putative  42.67 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000763333  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2398  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.84 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0686  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.44 
 
 		 266 aa  53.9  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000562829  hitchhiker  2.64678e-17 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0833  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.98 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3210  DNA methylase N-4/N-6  35.06 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.1 
 
 		 471 aa  50.8  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.97 
 
 		 222 aa  50.1  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6856  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.25 
 
 		 313 aa  49.3  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0555121 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6265  hypothetical protein  48.94 
 
 		 80 aa  49.3  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3617  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.08 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0379764  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.85 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2276  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.1 
 
 		 403 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1218  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.86 
 
 		 376 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2756  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  52.5 
 
 		 311 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.72 
 
 		 370 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  32.86 
 
 		 368 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1173  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.86 
 
 		 389 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1085  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.48 
 
 		 540 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  33.33 
 
 		 239 aa  47  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0941  DNA methylase  31.87 
 
 		 309 aa  47.4  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3353  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  20.27 
 
 		 314 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0413  modification methylase CcrMI  32.91 
 
 		 378 aa  46.6  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  29.17 
 
 		 380 aa  46.6  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3343  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.93 
 
 		 369 aa  46.2  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  hitchhiker  0.00000416126 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1962  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.62 
 
 		 259 aa  46.2  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2231  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.08 
 
 		 369 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0921492  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2384  DNA methylase  30.99 
 
 		 232 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.114492  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.36 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6269  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.36 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  33.33 
 
 		 441 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2206  methyltransferase DNA modification enzyme  37.93 
 
 		 414 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.612218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3008  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.39 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.367581 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2654  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  33.33 
 
 		 447 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1911  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.39 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1055  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.72 
 
 		 849 aa  45.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000157491  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1468  site-specific DNA-methyltransferase  30.88 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0965  DNA methylase N-4/N-6  29.76 
 
 		 379 aa  44.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2607  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.92 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000328335 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2152  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.07 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0119  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.88 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0066  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.88 
 
 		 372 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  28.3 
 
 		 367 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  29.41 
 
 		 389 aa  44.3  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.88 
 
 		 359 aa  44.3  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.82 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0708  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.29 
 
 		 545 aa  44.3  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.43 
 
 		 368 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2101  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.3 
 
 		 376 aa  43.5  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1810  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.25 
 
 		 329 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.94 
 
 		 379 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3051  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.38 
 
 		 305 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1449  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.57 
 
 		 360 aa  43.9  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.103238  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1954  DNA methylase  33.33 
 
 		 282 aa  43.5  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000695995  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3181  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.55 
 
 		 398 aa  43.1  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.94 
 
 		 380 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0203  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.81 
 
 		 319 aa  42.7  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3505  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.55 
 
 		 398 aa  43.1  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.602417 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  31.94 
 
 		 377 aa  43.1  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.33 
 
 		 225 aa  42.7  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2332  DNA adenine methylase CcrM  34.48 
 
 		 344 aa  42.7  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.160434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.59 
 
 		 884 aa  42.7  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2243  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.73 
 
 		 285 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000134525  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3376  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.55 
 
 		 370 aa  42.7  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3656  adenine specific DNA methylase Mod  39.62 
 
 		 567 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000129355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>