More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1349 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 263 aa  537  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  82.13 
 
 		 263 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1372  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  82.13 
 
 		 263 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  81.75 
 
 		 263 aa  454  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.018865 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  80.61 
 
 		 263 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  82.13 
 
 		 263 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  82.13 
 
 		 263 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  82.13 
 
 		 263 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  82.13 
 
 		 263 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  79.47 
 
 		 263 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  80.92 
 
 		 263 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  76.43 
 
 		 263 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1205  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  80.3 
 
 		 264 aa  428  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  77.22 
 
 		 263 aa  427  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1384  cobyrinic acid ac-diamide synthase  72.52 
 
 		 263 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1641  cobyrinic acid ac-diamide synthase  73.66 
 
 		 263 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  56.75 
 
 		 259 aa  301  5.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02865  putative ParA family protein  57.94 
 
 		 254 aa  302  5.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.827974  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  55.95 
 
 		 258 aa  300  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  56.35 
 
 		 259 aa  300  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1526  parA family protein  55.3 
 
 		 262 aa  296  3e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429591  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  54.37 
 
 		 255 aa  294  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.28 
 
 		 284 aa  268  7e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.97 
 
 		 265 aa  265  8e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3025  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.76 
 
 		 259 aa  261  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0990  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.78 
 
 		 265 aa  259  3e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37153  normal  0.791697 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.66 
 
 		 262 aa  258  8e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1968  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.38 
 
 		 265 aa  257  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3421  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.99 
 
 		 257 aa  255  5e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.786634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3864  putative plasmid partitioning protein  49.61 
 
 		 262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45520  putative plasmid partitioning protein  49.61 
 
 		 262 aa  251  7e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.922179 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2798  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50 
 
 		 262 aa  250  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.519748  normal  0.161878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1570  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.42 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601038  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3660  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.62 
 
 		 263 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.43 
 
 		 262 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2157  putative plasmid partitioning protein  49.24 
 
 		 266 aa  237  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4334  ParA family protein  47.43 
 
 		 262 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.873064  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1533  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.43 
 
 		 262 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.344504 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1182  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.03 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.14884 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3430  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.74 
 
 		 262 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1986  ParA family protein  45.74 
 
 		 262 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1856  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.5 
 
 		 260 aa  205  5e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.204496  normal  0.925256 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00028  chromosome partioning protein  39.25 
 
 		 260 aa  198  6e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.287581  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.16 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.71944  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1153  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.15 
 
 		 258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.488153  normal  0.157692 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0777  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.3 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  36.22 
 
 		 257 aa  168  7e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  36.22 
 
 		 257 aa  168  7e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1574  ParA family protein  38.46 
 
 		 258 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0302854  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  33.59 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.48 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.04 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  34.14 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  35.51 
 
 		 294 aa  151  8.999999999999999e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  33.46 
 
 		 253 aa  150  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.2 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.89 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.21 
 
 		 284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.57 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.26 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.83 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.47 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.43 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1467  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.76 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.162034  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1728  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.77 
 
 		 273 aa  147  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.04 
 
 		 287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.85 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1407  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.17 
 
 		 267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.46 
 
 		 337 aa  145  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  33.46 
 
 		 293 aa  145  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.04 
 
 		 299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.85 
 
 		 254 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  32.42 
 
 		 253 aa  145  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.25 
 
 		 329 aa  145  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.27 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.73 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  32.65 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  32.66 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.84 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.75 
 
 		 253 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.47 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  33.86 
 
 		 327 aa  143  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  31.4 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.04 
 
 		 362 aa  143  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.73 
 
 		 303 aa  143  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13239  hypothetical protein  33.84 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.614127  normal  0.5818 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.28 
 
 		 298 aa  142  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4678  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.46 
 
 		 267 aa  142  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993482  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.08 
 
 		 270 aa  142  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.06 
 
 		 329 aa  142  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.68 
 
 		 253 aa  142  7e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.68 
 
 		 293 aa  141  8e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.01 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.287869  normal  0.696383 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  32.65 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0915  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.96 
 
 		 275 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412343  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  33.06 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.47 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  34.85 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  33.98 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.74 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>