252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0930 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000127  NAD(P) transhydrogenase subunit beta  71.05 
 
 		 458 aa  677    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129759  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01571  pyridine nucleotide transhydrogenase  72.64 
 
 		 462 aa  695    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2041  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  72.64 
 
 		 462 aa  695    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181904  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2079  pyridine nucleotide transhydrogenase  73.23 
 
 		 457 aa  674    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1676  pyridine nucleotide transhydrogenase  72.64 
 
 		 462 aa  695    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.544393  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1788  pyridine nucleotide transhydrogenase  72.64 
 
 		 462 aa  695    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850181  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1648  pyridine nucleotide transhydrogenase  72.23 
 
 		 462 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250723  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1784  pyridine nucleotide transhydrogenase  69.57 
 
 		 469 aa  660    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1694  pyridine nucleotide transhydrogenase  72.23 
 
 		 462 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00431675  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3741  pyridine nucleotide transhydrogenase  81.58 
 
 		 469 aa  805    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0942  pyridine nucleotide transhydrogenase  82.79 
 
 		 494 aa  829    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1597  pyridine nucleotide transhydrogenase  72.84 
 
 		 462 aa  694    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.240547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1831  pyridine nucleotide transhydrogenase  73.04 
 
 		 464 aa  713    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1862  pyridine nucleotide transhydrogenase  72.84 
 
 		 462 aa  656    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.534712  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0498  pyridine nucleotide transhydrogenase  72.65 
 
 		 458 aa  684    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000166801  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2584  pyridine nucleotide transhydrogenase  73.04 
 
 		 464 aa  700    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2400  pyridine nucleotide transhydrogenase  73.44 
 
 		 462 aa  679    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228606  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2295  pyridine nucleotide transhydrogenase  73.04 
 
 		 464 aa  713    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.790877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2107  pyridine nucleotide transhydrogenase  73.84 
 
 		 462 aa  682    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.326221  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2028  pyridine nucleotide transhydrogenase  72.64 
 
 		 462 aa  695    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1580  pyridine nucleotide transhydrogenase  72.23 
 
 		 462 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.339018  normal  0.19907 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1850  pyridine nucleotide transhydrogenase  72.43 
 
 		 462 aa  697    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.513378  normal  0.520422 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01561  hypothetical protein  72.64 
 
 		 462 aa  695    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05734  pyridine nucleotide transhydrogenase  72.27 
 
 		 464 aa  692    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0930  pyridine nucleotide transhydrogenase  100 
 
 		 494 aa  987    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.339922  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0951  pyridine nucleotide transhydrogenase  82.79 
 
 		 494 aa  829    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3418  pyridine nucleotide transhydrogenase  82.79 
 
 		 494 aa  828    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2312  pyridine nucleotide transhydrogenase  72.64 
 
 		 462 aa  695    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1861  pyridine nucleotide transhydrogenase  72.03 
 
 		 462 aa  683    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.885026 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0624  pyridine nucleotide transhydrogenase  72.27 
 
 		 458 aa  706    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0233  pyridine nucleotide transhydrogenase  73.44 
 
 		 486 aa  706    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.448923  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0917  pyridine nucleotide transhydrogenase  82.79 
 
 		 494 aa  829    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3082  pyridine nucleotide transhydrogenase  82.79 
 
 		 494 aa  825    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.167406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0890  pyridine nucleotide transhydrogenase  82.79 
 
 		 494 aa  825    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0967297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3195  pyridine nucleotide transhydrogenase  86.23 
 
 		 494 aa  857    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1589  pyridine nucleotide transhydrogenase  72.23 
 
 		 462 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250621  normal  0.984324 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0853  pyridine nucleotide transhydrogenase  82.79 
 
 		 494 aa  825    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3066  pyridine nucleotide transhydrogenase  81.78 
 
 		 494 aa  823    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00270245  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1809  pyridine nucleotide transhydrogenase  72.64 
 
 		 462 aa  695    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.391181  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2841  pyridine nucleotide transhydrogenase  83.2 
 
 		 494 aa  834    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0565  pyridine nucleotide transhydrogenase  66.8 
 
 		 458 aa  637    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1942  pyridine nucleotide transhydrogenase  73.04 
 
 		 464 aa  713    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.530716  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2830  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  67.14 
 
 		 466 aa  633  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0233716 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1757  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  67 
 
 		 466 aa  628  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.284684  normal  0.879821 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0904  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  63.55 
 
 		 463 aa  592  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.278692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2266  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  62.17 
 
 		 462 aa  585  1e-166  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.340429  normal  0.366293 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0192  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  63.1 
 
 		 473 aa  580  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.483565  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0548  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  62.45 
 
 		 482 aa  580  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1397  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  60.72 
 
 		 481 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2245  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  64.21 
 
 		 468 aa  578  1e-164  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0261  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  60.76 
 
 		 482 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07830  NAD/NADP transhydrogenase beta subunit  60.92 
 
 		 472 aa  578  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.368 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2767  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  59.24 
 
 		 465 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2173  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  62.4 
 
 		 468 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.04177  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2120  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  60.6 
 
 		 467 aa  574  1.0000000000000001e-162  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00228007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1077  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  62.85 
 
 		 480 aa  569  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0707  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  61.26 
 
 		 477 aa  566  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.769172 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3753  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  59.72 
 
 		 471 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.423097  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0261  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  61.71 
 
 		 471 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7227  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.45 
 
 		 470 aa  560  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346916  normal  0.136469 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1815  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  60.12 
 
 		 492 aa  552  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380425  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1652  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  60.59 
 
 		 471 aa  550  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000557684  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1723  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  61.12 
 
 		 491 aa  548  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0100  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  63.79 
 
 		 479 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0090  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  63.79 
 
 		 479 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.190826 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0109  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  63.79 
 
 		 479 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4666  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  60.36 
 
 		 465 aa  545  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0239  pyridine nucleotide transhydrogenase beta subunit  61.05 
 
 		 482 aa  547  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.993412  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1882  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  61.05 
 
 		 482 aa  547  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1581  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  60.85 
 
 		 482 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5779  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.25 
 
 		 470 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496694  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3899  NAD(P)+ transhydrogenase beta chain  59.23 
 
 		 477 aa  544  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0665157  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2784  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  57.96 
 
 		 472 aa  544  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327338 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4047  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.86 
 
 		 479 aa  538  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.754185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1234  NAD(P)(+) transhydrogenase  57.57 
 
 		 498 aa  536  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.035089 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2491  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  60.69 
 
 		 480 aa  536  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5543  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  58.25 
 
 		 470 aa  535  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.362184  normal  0.925993 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3281  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  56.59 
 
 		 502 aa  526  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0119  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  63.87 
 
 		 479 aa  526  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2278  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  57.6 
 
 		 466 aa  520  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.314392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0727  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  63.87 
 
 		 479 aa  514  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24220  NAD/NADP transhydrogenase beta subunit  59.54 
 
 		 475 aa  513  1e-144  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2181  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  50.91 
 
 		 464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5464  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  47.75 
 
 		 484 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0277  pyridine nucleotide transhydrogenase subunit beta  49.11 
 
 		 478 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4006  putative NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  48.43 
 
 		 484 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2562  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.54 
 
 		 486 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356594 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6856  pyridine nucleotide transhydrogenase (proton pump), beta subunit  49.8 
 
 		 465 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02470  pyridine nucleotide transhydrogenase, beta subunit  49.11 
 
 		 478 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5018  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  47.36 
 
 		 484 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0557  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  49.69 
 
 		 466 aa  430  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0972119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0634  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  50.21 
 
 		 470 aa  432  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.282238  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0155  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.72 
 
 		 478 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000848763 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6364  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  47.77 
 
 		 488 aa  425  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275177  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5290  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  47.77 
 
 		 488 aa  425  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240132  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1261  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  47.74 
 
 		 484 aa  425  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1229  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  49.4 
 
 		 466 aa  426  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47305  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2972  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.95 
 
 		 486 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0173  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.72 
 
 		 478 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0895  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  50.1 
 
 		 472 aa  427  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.479914  normal  0.207248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>