73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1555 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1555  NnrS family protein  100 
 
 		 410 aa  816    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000108211  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1349  NnrS  49.88 
 
 		 416 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000146845  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2680  NnrS family protein  29.33 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1808  NnrS family protein  27.4 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193924  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2901  NnrS family protein  25.06 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0259  hypothetical protein  25.19 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0283  hypothetical protein  25.19 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0720  putative heme-Cu membrane protein (NnrS)  25.37 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1006  NnrS family protein  28.7 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0347076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2849  NnrS family protein  27.78 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0557  NnrS  24.74 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.042435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2303  hypothetical protein  24.73 
 
 		 432 aa  69.7  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2322  NnrS family protein  24.38 
 
 		 390 aa  67  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000140024  normal  0.965133 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1910  hypothetical protein  25.24 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03317  hypothetical protein  24.46 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0648  NnrS  25.37 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86713  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3791  NnrS  23.78 
 
 		 409 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.527545  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0102  hypothetical protein  24.21 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.139814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2607  NnrS family protein  25.25 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2560  NnrS family protein  24.81 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12013  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2574  NnrS family protein  34.02 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00111099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1475  NnrS family protein  35.56 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0760953 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2105  NnrS family protein  35.05 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0196977  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1410  NnrS-like protein  25.85 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3473  NnrS  24.42 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6821  putative membrane protein, NnrS-like protein  36.46 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0494  NnrS family protein  26.38 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.506659  normal  0.505655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1673  NnrS family protein  34.74 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496066  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4230  NnrS family protein  23.6 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0967  NnrS family protein  37.37 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2840  NnrS family protein  27.01 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2940  NnrS family protein  26.18 
 
 		 393 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1450  NnrS family protein  25.81 
 
 		 425 aa  56.2  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.9412  normal  0.157147 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1235  NnrS  32.35 
 
 		 403 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00575591  unclonable  0.0000000301222 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002671  NnrS protein  24.7 
 
 		 394 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4283  hypothetical protein  38.57 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3970  NnrS family protein  37.5 
 
 		 398 aa  54.3  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4275  NnrS  35.14 
 
 		 401 aa  53.5  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2876  NnrS family protein  32.11 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534905  hitchhiker  0.00000000207371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2168  NnrS  24.07 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03874  Heme/copper membrane protein  30.3 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5672  NnrS family protein  32.73 
 
 		 392 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4037  NnrS  32.35 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4727  NnrS  33.33 
 
 		 398 aa  50.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6279  NnrS family protein  31.75 
 
 		 403 aa  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  0.20499 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3859  NnrS family protein  24.73 
 
 		 391 aa  50.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3145  NnrS family protein  24.07 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0163982  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0227  NnrS family protein  25.5 
 
 		 390 aa  49.7  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0765  NnrS family protein  23.99 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.960663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2159  NnrS family protein  39.34 
 
 		 398 aa  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0400909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1348  hypothetical protein  26.67 
 
 		 417 aa  46.6  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2322  NnrS family protein  33 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138032  normal  0.897473 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2847  NnrS family protein  22.17 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3582  NnrS family protein  25 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.936992  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1119  NnrS  29.32 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1524  NnrS family protein  33.8 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2336  NnrS family protein  22.28 
 
 		 401 aa  44.7  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00114269  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3610  NnrS family protein  26.75 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.84805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4044  NnrS family protein  32.95 
 
 		 504 aa  43.9  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1810  hypothetical protein  27.63 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427105  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0328  hypothetical protein  35.35 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2741  hypothetical protein  27.63 
 
 		 442 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.300362  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3288  NnrS family protein  26.99 
 
 		 404 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1973  NnrS family protein  35.35 
 
 		 397 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0630  Heme/copper membrane protein of NnrS family protein  26.67 
 
 		 394 aa  43.5  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4999  NnrS  31.67 
 
 		 405 aa  43.5  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.441301  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0630  hypothetical protein  27.63 
 
 		 407 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446034  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2382  hypothetical protein  27.63 
 
 		 407 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.863987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2905  hypothetical protein  27.63 
 
 		 407 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2683  hypothetical protein  27.63 
 
 		 407 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1409  hypothetical protein  31.58 
 
 		 424 aa  43.1  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.922088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0686  NnrS family protein  32.04 
 
 		 431 aa  43.1  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2830  hypothetical protein  29.55 
 
 		 409 aa  42.7  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>