28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1829 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_1829  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 
306 aa  632  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.349811  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5903  methionine sulfoxide reductase A  57.82 
 
 
311 aa  354  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4747  methionine sulfoxide reductase A  40.88 
 
 
301 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0553  hypothetical protein, putative phage gene  36.52 
 
 
294 aa  203  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.070631  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0802  hypothetical protein  40.14 
 
 
279 aa  198  8e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  2.0853e-13  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1217  hypothetical protein  38.28 
 
 
299 aa  197  2e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0087  methionine sulfoxide reductase A  35.67 
 
 
299 aa  195  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000549703  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2394  hypothetical protein  39.37 
 
 
291 aa  193  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  5.39888e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0486  hypothetical protein  36.5 
 
 
281 aa  188  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013307 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3168  hypothetical protein  38.73 
 
 
294 aa  170  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2410  hypothetical protein  35.07 
 
 
300 aa  168  8e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1152  hypothetical protein  34.15 
 
 
334 aa  159  5e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363384  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2225  hypothetical protein  31.88 
 
 
298 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0918911  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0232  hypothetical protein  37.46 
 
 
313 aa  152  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.227271  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0619  hypothetical protein  29.66 
 
 
318 aa  143  4e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1942  hypothetical protein  30.87 
 
 
308 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.350781  normal  0.226641 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3728  hypothetical protein  33.68 
 
 
324 aa  121  1e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.926929  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0622  hypothetical protein  30.94 
 
 
271 aa  116  6e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03110  hypothetical protein  28.18 
 
 
277 aa  108  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0440905  hitchhiker  1.2887e-20 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1485  hypothetical protein  28.73 
 
 
275 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3849  hypothetical protein  40 
 
 
102 aa  85.5  1e-15  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3776  hypothetical protein  40 
 
 
102 aa  85.5  1e-15  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0123  excinuclease ABC subunit C  29.65 
 
 
296 aa  79.7  5e-14  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1177  hypothetical protein  27.15 
 
 
284 aa  79  1e-13  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027744  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3080  hypothetical protein  35.42 
 
 
157 aa  61.6  1e-08  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.178207 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3159  methionine sulfoxide reductase A  22.57 
 
 
306 aa  56.2  6e-07  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.414524  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1147  hypothetical protein  25.84 
 
 
320 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.01 
 
 
626 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>