273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0899 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0899  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  100 
 
 		 199 aa  409  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000786086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2990  flavodoxin/nitric oxide synthase  67.01 
 
 		 198 aa  276  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.991698  hitchhiker  0.0079617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4229  flavodoxin/nitric oxide synthase  67.01 
 
 		 198 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234243  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0913  flavodoxin/nitric oxide synthase  65.99 
 
 		 203 aa  270  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1766  NAD(P)H:quinone oxidoreductase, type IV  63.4 
 
 		 197 aa  269  2e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0408  trp repressor binding protein  63.4 
 
 		 197 aa  269  2e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1246  flavoprotein WrbA  64.47 
 
 		 201 aa  263  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000168945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1206  flavoprotein WrbA  63.96 
 
 		 201 aa  261  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1686  trp repressor binding protein  62.94 
 
 		 201 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3703  flavodoxin/nitric oxide synthase  62.94 
 
 		 201 aa  260  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1644  trp repressor binding protein  63.45 
 
 		 201 aa  258  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4073  flavodoxin/nitric oxide synthase  63.45 
 
 		 201 aa  258  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4560  Trp repressor binding protein WrbA  63.96 
 
 		 198 aa  258  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.309608  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51990  Trp repressor binding protein WrbA  62.94 
 
 		 198 aa  254  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1823  flavodoxin/nitric oxide synthase  64.06 
 
 		 199 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  63.92 
 
 		 200 aa  252  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.938759  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2485  flavodoxin/nitric oxide synthase  58.46 
 
 		 198 aa  249  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0700  hypothetical protein  58.88 
 
 		 199 aa  246  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0682  hypothetical protein  58.88 
 
 		 199 aa  246  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2247  flavoprotein WrbA  60.42 
 
 		 205 aa  244  9e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0980  flavodoxin/nitric oxide synthase  60.42 
 
 		 202 aa  243  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0715  flavoprotein WrbA  60.94 
 
 		 197 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.358899 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1979  tryptophan repressor binding protein  60.94 
 
 		 197 aa  241  3.9999999999999997e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0631  flavodoxin/nitric oxide synthase  60.41 
 
 		 212 aa  240  9e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1897  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.9 
 
 		 209 aa  239  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1861  flavodoxin  60.82 
 
 		 687 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697937  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2340  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.92 
 
 		 200 aa  239  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200739 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0439  tryptophan repressor binding protein  59.38 
 
 		 199 aa  237  6.999999999999999e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0384  flavoprotein WrbA  59.38 
 
 		 199 aa  237  1e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1130  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.38 
 
 		 209 aa  236  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0057993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1684  NADPH-dependent FMN reductase  60.82 
 
 		 202 aa  236  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.866798  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0755  flavodoxin  60.82 
 
 		 202 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383175  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0941  flavodoxin  60.82 
 
 		 202 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0549  putative Trp repressor binding protein  62.89 
 
 		 205 aa  236  2e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1706  NADPH-dependent FMN reductase  60.82 
 
 		 202 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36830  WrbA-like flavodoxin  62.94 
 
 		 200 aa  236  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.740574  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0407  flavodoxin  60.82 
 
 		 202 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2619  flavodoxin  61.34 
 
 		 202 aa  236  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1474  flavodoxin  60.82 
 
 		 202 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0867  flavoprotein WrbA  59.07 
 
 		 202 aa  235  3e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0748564  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1249  NADPH-dependent FMN reductase:flavodoxin/nitric oxide synthase  59.38 
 
 		 200 aa  235  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.905  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1995  flavoprotein WrbA  60.42 
 
 		 197 aa  235  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1665  flavoprotein WrbA  60.42 
 
 		 197 aa  235  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204501  hitchhiker  0.00540913 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0705  flavodoxin/nitric oxide synthase  58.03 
 
 		 220 aa  234  7e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1474  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1558  TRP repressor binding protein  58.85 
 
 		 201 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04556  tryptophan repressor binding protein  57.81 
 
 		 218 aa  233  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.816043  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0537  flavodoxin/nitric oxide synthase  62.37 
 
 		 205 aa  233  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888496 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1433  flavoprotein WrbA  62.57 
 
 		 206 aa  232  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0973  flavodoxin/nitric oxide synthase  62.57 
 
 		 206 aa  232  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0780306  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1336  flavodoxin/nitric oxide synthase  62.57 
 
 		 206 aa  232  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.481655  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1455  flavodoxin/nitric oxide synthase  62.57 
 
 		 206 aa  232  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2774  flavoprotein WrbA  60.2 
 
 		 200 aa  231  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3069  flavodoxin-like protein  58.33 
 
 		 198 aa  229  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.432129  hitchhiker  0.00072414 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1353  putative Trp repressor binding protein  58.97 
 
 		 200 aa  229  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.873787  normal  0.272914 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2779  flavoprotein WrbA  58.85 
 
 		 199 aa  229  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1376  flavoprotein WrbA  62.5 
 
 		 206 aa  228  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.79766 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4600  flavodoxin/nitric oxide synthase  62.5 
 
 		 206 aa  228  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573755  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1860  flavoprotein WrbA  62.5 
 
 		 203 aa  228  6e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000177757 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2521  Trp repressor-binding protein  61.86 
 
 		 205 aa  227  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02144  Flavodoxin/nitric oxide synthase  57.14 
 
 		 200 aa  220  8e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0314978  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1576  flavoprotein WrbA  59 
 
 		 202 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0737  flavoprotein WrbA  56.25 
 
 		 197 aa  212  3.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.438501  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0558  flavoprotein WrbA  52.31 
 
 		 205 aa  211  7e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.731292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0520  flavodoxin/nitric oxide synthase  60.36 
 
 		 184 aa  204  8e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03195  hypothetical protein  57.29 
 
 		 190 aa  202  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002786  Trp repressor-binding protein  57.81 
 
 		 189 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1746  Trp repressor-binding protein  53.65 
 
 		 186 aa  194  8.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  44.1 
 
 		 200 aa  158  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  42.27 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  43.08 
 
 		 200 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  43.08 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  43.08 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  43.08 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  43.08 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  40.91 
 
 		 200 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  42.56 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  42.56 
 
 		 200 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  41.71 
 
 		 204 aa  148  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  43.72 
 
 		 203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  41.33 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0896  flavoprotein WrbA  41.5 
 
 		 197 aa  144  8.000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0428  NADPH-dependent FMN reductase  40.49 
 
 		 197 aa  143  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  40.21 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0373  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.41 
 
 		 202 aa  143  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267004  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  39.69 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  40.51 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  42.21 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  39.22 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  42.56 
 
 		 199 aa  142  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1683  flavoprotein WrbA  41.41 
 
 		 207 aa  140  9e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.308348  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  37.81 
 
 		 200 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  37.81 
 
 		 200 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  37.75 
 
 		 204 aa  138  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  41.84 
 
 		 199 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  37.5 
 
 		 204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  40.31 
 
 		 199 aa  135  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  40.51 
 
 		 200 aa  135  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  35.5 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4089  flavoprotein WrbA  40 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  39.49 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>