More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0206 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0206  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  100 
 
 		 207 aa  425  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00203  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  96.62 
 
 		 207 aa  411  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3398  Methyltransferase type 11  96.14 
 
 		 207 aa  410  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3455  methyltransferase type 11  96.62 
 
 		 207 aa  410  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.915003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00208  hypothetical protein  96.62 
 
 		 207 aa  411  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  92.2 
 
 		 256 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  92.2 
 
 		 256 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  90.73 
 
 		 256 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  90.73 
 
 		 256 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  70.1 
 
 		 256 aa  306  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  70.59 
 
 		 256 aa  305  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  70.1 
 
 		 256 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  70.1 
 
 		 256 aa  304  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  66.83 
 
 		 256 aa  302  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  69.61 
 
 		 256 aa  301  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  60.29 
 
 		 257 aa  260  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  63 
 
 		 256 aa  252  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3296  hypothetical protein  61.9 
 
 		 212 aa  250  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.114197  normal  0.0687983 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3145  hypothetical protein  61.38 
 
 		 204 aa  246  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.725921  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  59.8 
 
 		 256 aa  243  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  57.21 
 
 		 255 aa  236  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3284  methyltransferase type 11  62.13 
 
 		 173 aa  228  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.859694  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  54.68 
 
 		 255 aa  226  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  54.19 
 
 		 254 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  54.19 
 
 		 254 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  53.69 
 
 		 254 aa  217  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  53.2 
 
 		 254 aa  215  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  54.27 
 
 		 253 aa  215  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  57.14 
 
 		 187 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0761957 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  50.25 
 
 		 259 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  50.25 
 
 		 259 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  49.25 
 
 		 254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  49.25 
 
 		 254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  48.24 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  50.25 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  48.02 
 
 		 250 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  48.76 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  47.52 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  47.52 
 
 		 250 aa  191  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  47.52 
 
 		 250 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  47.52 
 
 		 250 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  48.76 
 
 		 259 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  47.78 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  46.77 
 
 		 256 aa  185  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  47.76 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  47.26 
 
 		 250 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  48.76 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0336  methyltransferase type 11  48.04 
 
 		 261 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.549644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0587  UbiE/COQ5 methyltransferase  47.55 
 
 		 261 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846793  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  46.19 
 
 		 250 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2729  SAM-dependent methyltransferase  42.86 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  46.19 
 
 		 250 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5564  methyltransferase type 11  50.28 
 
 		 258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  45.64 
 
 		 256 aa  178  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  47.03 
 
 		 251 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  47.03 
 
 		 251 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  45.05 
 
 		 251 aa  177  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0249  Methyltransferase type 11  45.59 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220437  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2361  methyltransferase type 11  45.59 
 
 		 254 aa  175  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  46.53 
 
 		 251 aa  174  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  46.04 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  46.04 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  46.04 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  46.04 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  30.1 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  29.17 
 
 		 261 aa  99  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.21 
 
 		 261 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.46 
 
 		 258 aa  98.2  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.46 
 
 		 258 aa  98.2  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.69 
 
 		 261 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.65 
 
 		 261 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.27 
 
 		 261 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  28.27 
 
 		 261 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2697  methyltransferase type 11  31.18 
 
 		 264 aa  94.4  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.46 
 
 		 261 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0301  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.1 
 
 		 257 aa  85.9  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  40.38 
 
 		 253 aa  75.1  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.79 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.2 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3752  Methyltransferase type 11  33.74 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.51014  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1569  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.46 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.46 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.46 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.46 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.46 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.46 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.46 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3776  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.46 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0393069  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.76 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  41.11 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  33.94 
 
 		 246 aa  67  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.41 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1437  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.91 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.82 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  38.3 
 
 		 251 aa  65.1  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1567  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.8 
 
 		 258 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00051335  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.65 
 
 		 245 aa  64.7  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4199  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  39.77 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.68 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.21 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>